| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen36_23 | 1 = | 0 (0.000) | 428 (0.730) | 106/192 | 0.9 | 100% | intergenic (–/+1574) | –/Xen36_02602 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen36_30 | = 1165 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 432 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATT > Xen36_23/1‑149 | gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGt < 1:2200656‑M1/54‑1 (MQ=255)gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGt > 1:1717724‑M1/97‑150 (MQ=255)gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGt > 1:357299‑M1/97‑150 (MQ=255)gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGt < 1:245919‑M1/54‑1 (MQ=255)gcttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGt < 1:2934148‑M1/54‑1 (MQ=255) cttcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTATCAACTTCTTGtc > 1:754219‑M1/96‑150 (MQ=255) tcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctc > 1:3652151‑M1/94‑150 (MQ=255) tcgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTCGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctc > 1:2659861‑M1/94‑150 (MQ=255) cgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctct > 1:1438100‑M1/93‑150 (MQ=255) cgtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctct > 1:2990260‑M1/93‑150 (MQ=255) gtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgtctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc < 1:3610386‑M1/59‑1 (MQ=255) gtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc < 1:661866‑M1/59‑1 (MQ=255) gtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc < 1:1821602‑M1/59‑1 (MQ=255) gtttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGtctctc < 1:2120232‑M1/59‑1 (MQ=255) tttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCa > 1:1539000‑M1/91‑150 (MQ=255) tttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCa < 1:1034603‑M1/60‑1 (MQ=255) tttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCa < 1:625269‑M1/60‑1 (MQ=255) tttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCa > 1:797498‑M1/91‑150 (MQ=255) ttaacttttgttgttgaccattgtcaacttcttgcctctcattattagcttcgtttaacttttgttgctgaccattgtcaacttcttgtCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGATCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCat < 1:1281611‑M1/61‑1 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATTGTCAACTTCTTGTCTCTCATTATTAGCTTCGTTTAACTTTTGTTGTTGACCATT > Xen36_23/1‑149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |