| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 623 total aligned reads displayed.
GGTTTCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1465‑1675 | ggTTTCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCa > 1:1997941/1‑150 (MQ=255) tttCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaa < 1:351816/150‑1 (MQ=255) ttCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAAc < 1:2103049/150‑1 (MQ=255) ttCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAAc < 1:3675732/150‑1 (MQ=255) tCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAAct > 1:1262984/1‑150 (MQ=255) gAAGTTATCCCAGTCTTAGAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTcc < 1:2511216/150‑1 (MQ=255) tATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATaaa < 1:3096577/150‑1 (MQ=255) tATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATaaa > 1:1337829/1‑150 (MQ=255) ccAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAAtt > 1:2970797/1‑150 (MQ=255) 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tataGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGANCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGt > 1:1379086/1‑150 (MQ=255) ggtaggtTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGa > 1:1859398/1‑150 (MQ=255) gtaggtTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGAt > 1:1748729/1‑150 (MQ=255) aggtTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTa > 1:3150789/1‑150 (MQ=255) ttATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATATATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCt < 1:138870/150‑1 (MQ=255) 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aGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaat < 1:1223284‑M2/150‑116 (MQ=255) ggCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatg < 1:1450741‑M2/150‑117 (MQ=255) gccgccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcat > 1:2180861‑M2/1‑29 (MQ=255) ccgccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagctttcaatgttcattt > 1:601245‑M1/1‑90 (MQ=255) cgccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatta < 1:2153773‑M2/150‑124 (MQ=255) gccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaactaatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcgtttg > 1:2951398‑M2/1‑26 (MQ=255) gccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaat > 1:2573493‑M1/1‑88 (MQ=255) ccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaaa < 1:336714‑M2/150‑126 (MQ=255) ccAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcatttttc > 1:1556394‑M1/1‑87 (MQ=255) cAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaaaa < 1:2800217‑M2/150‑127 (MQ=255) aGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattttctt > 1:2703918‑M2/1‑23 (MQ=255) gTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTtatagttacgtttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaatgttcaa > 1:1396680‑M1/1‑82 (MQ=255) ttCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattttcttaccg > 1:1638788‑M2/1‑19 (MQ=255) ttCATCCTGAGCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattttcttaccg < 1:3722347‑M2/150‑132 (MQ=255) gCCAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaaaattatttatggagcgg > 1:1508262‑M2/1‑9 (MQ=255) cAGGATCaaactctccataaaaattatgatgtttgattagctcataaatactaaataatgtttgtaacttatagttacgttttttggaattaacgttgacatattgtcattcagttttcaatgttcattaaaattatttatggagcgggt > 1:3171135‑M2/1‑7 (MQ=255) | GGTTTCCCGAAGTTATCCCAGTCTTATAGGTAGGTTATCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGCAAGCTTCTCGTCCGTTCGCTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen36_28/1465‑1675 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |