| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen36_28 | = 1613 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACATATTGTCATTCAGTTTTCAATGTTCATTAAAATTATTTATGGAGCGGGTGATGGGA > Xen36_10/1‑150 | gcaagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGtttttt < 1:720386‑M1/78‑1 (MQ=255) caagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggtacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑g > 1:163786‑M1/72‑150 (MQ=255) caagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑g > 1:695367‑M1/72‑150 (MQ=255) aagcttctcgtccgttcgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑gg > 1:167427‑M1/71‑150 (MQ=255) 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cgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACata > 1:766658‑M1/55‑150 (MQ=255) cgctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACata < 1:1045699‑M1/96‑1 (MQ=255) gctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACatat < 1:2417290‑M1/97‑1 (MQ=255) gctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACatat < 1:953733‑M1/97‑1 (MQ=255) ctcgacttgcatgtattaggcacgccgccagcgttcatcctgagccaggatcAAACTCTCCATAAAAATTATGATGTTTGATTAGCTCATAAATACTAAATAATGTTTGTAACTTATAGTTACGTTTTTT‑GGAATTAACGTTGACATAtt > 1:2916876‑M1/53‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |