| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | Xen14_13 | = 98318 | 0 (0.000) | 37 (0.060) | 25/218 | 2.1 | 100% | intergenic (+227/–) | gltI/– | Glutamate/aspartate import solute‑binding protein/– |
| ? | Xen14_168 | = 590 | 0 (0.000) | intergenic (‑72/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
Only 100 of 995 total aligned reads displayed.
TCTTCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/441‑629 | tCTTCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAg < 1:497647/150‑1 (MQ=255)tCTTCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAg < 1:122470/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGCTATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTATTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAGATCAAAAgg > 1:1754442/1‑150 (MQ=255) ttCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAggg < 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cAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttctgtgcacaaaaaaacggcgctttttagcgccgtttttatttttcaaccttatttccagatacgtaactcatcgtccgttg < 1:1144369‑M1/150‑106 (MQ=255) | TCTTCGGTATTTTGGCGCAAATACTATGTGATATTTACAGTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/441‑629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |