| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_13 | = 98318 | 0 (0.000) | 37 (0.060) | 25/218 | 2.1 | 100% | intergenic (+227/–) | gltI/– | Glutamate/aspartate import solute‑binding protein/– |
| ? | Xen14_168 | = 590 | 0 (0.000) | intergenic (‑72/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98177‑98318 | gggCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgat > 1:3251577‑M1/1‑142 (MQ=255) ccTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCTAGTTATTAAAACCCcttttgatttg > 1:2823181‑M1/1‑139 (MQ=255) tGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCNAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAANCCCCAGCTAGGCTNGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgtt > 1:3722089‑M1/1‑137 (MQ=255) tGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgtt < 1:2448805‑M1/150‑14 (MQ=255) tGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgtt > 1:3349212‑M1/1‑137 (MQ=255) aaaCCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaa > 1:2986837‑M1/1‑134 (MQ=255) aaaCCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaa < 1:1314137‑M1/150‑17 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctg < 1:1810822‑M1/150‑32 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtcta < 1:1426484‑M1/150‑32 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtcta < 1:1426487‑M1/150‑32 (MQ=255) tAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggca > 1:4046587‑M1/1‑116 (MQ=255) tAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTATTTTTTGTGCCCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCTGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCAGGTTATTAAAACCActtttgatttgttaaaacaccttgcggtatggca > 1:4046585‑M1/1‑116 (MQ=255) aaCAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgctttgttaaaacaccttgcggtctggcaa > 1:5533‑M1/1‑115 (MQ=255) aaCAATCTTCGAGGGTAGCAATTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGTGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaa < 1:3964862‑M1/150‑36 (MQ=255) cAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaact > 1:2735589‑M1/1‑113 (MQ=255) cAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaact > 1:274198‑M1/1‑113 (MQ=255) aaTCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTATGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactg < 1:3304624‑M1/150‑39 (MQ=255) aaTCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactg < 1:3304626‑M1/150‑39 (MQ=255) aTCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCGCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgc < 1:1557572‑M1/150‑40 (MQ=255) aTCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCGCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgc < 1:1557570‑M1/150‑40 (MQ=255) ttCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaact < 1:203577‑M1/145‑38 (MQ=255) ggTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaa < 1:3873730‑M1/150‑49 (MQ=255) gTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaa < 1:2556233‑M1/150‑50 (MQ=255) aGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaaca > 1:1382274‑M1/1‑99 (MQ=255) cAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaag > 1:854143‑M1/1‑97 (MQ=255) cGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaa > 1:568114‑M1/1‑90 (MQ=255) cGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaa > 1:568115‑M1/1‑90 (MQ=255) cGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaa < 1:741852‑M1/150‑61 (MQ=255) tACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggg < 1:124500‑M1/150‑67 (MQ=255) tACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggg < 1:1217697‑M1/150‑67 (MQ=255) ccTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtc < 1:2848232‑M1/150‑70 (MQ=255) ctctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtcc < 1:1032851‑M1/150‑71 (MQ=255) ctctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaaatgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtcc > 1:3483405‑M1/1‑80 (MQ=255) ctctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctgg > 1:470862‑M1/1‑80 (MQ=255) ctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtccca > 1:38883‑M1/1‑78 (MQ=255) ctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtccca > 1:38887‑M1/1‑78 (MQ=255) ctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtccca > 1:1009228‑M1/1‑78 (MQ=255) | GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98177‑98318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |