| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_13 | = 98318 | 0 (0.000) | 37 (0.060) | 25/218 | 2.1 | 100% | intergenic (+227/–) | gltI/– | Glutamate/aspartate import solute‑binding protein/– |
| ? | Xen14_168 | = 590 | 0 (0.000) | intergenic (‑72/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98177‑98318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggaaagctttcagctttgagccagttattaaaacccCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA < Xen14_168/590‑519 GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGAT > 1:3251577/1‑150 CCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCTAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTG > 1:2823181/1‑150 TGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCNAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAANCCCCAGCTAGGCTNGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTT > 1:3722089/1‑150 TGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTT < 1:2448805/150‑1 TGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTT > 1:3349212/1‑150 AAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAA > 1:2986837/1‑150 AAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAA < 1:1314137/150‑1 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTa < 1:1426484/150‑2 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTa < 1:1426487/150‑2 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTG < 1:1810822/150‑1 TAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCA > 1:4046587/1‑150 TAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTATTTTTTGTGCCCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCTGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCAGGTTATTAAAACCACTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTATGGCA > 1:4046585/1‑150 AACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGCTTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAA > 1:5533/1‑150 AACAATCTTCGAGGGTAGCAATTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGTGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAA < 1:3964862/150‑1 CAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACT > 1:2735589/1‑150 CAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACT > 1:274198/1‑150 AATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTATGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTG < 1:3304624/150‑1 AATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTG < 1:3304626/150‑1 ATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCGCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGC < 1:1557572/150‑1 ATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCGCAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGC < 1:1557570/150‑1 TTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACT < 1:203577/145‑1 GGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAA < 1:3873730/150‑1 GTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAA < 1:2556233/150‑1 AGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACA > 1:1382274/1‑150 CAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAG > 1:854143/1‑150 CGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAA > 1:568114/1‑150 CGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAA > 1:568115/1‑150 CGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAA < 1:741852/150‑1 TACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGG < 1:124500/150‑1 TACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGG < 1:1217697/150‑1 CCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTC < 1:2848232/150‑1 CTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCC < 1:1032851/150‑1 CTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAAATGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCC > 1:3483405/1‑150 CTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGG > 1:470862/1‑112 CTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA > 1:38883/1‑150 CTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA > 1:38887/1‑150 CTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA > 1:1009228/1‑150 GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98177‑98318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggaaagctttcagctttgagccagttattaaaacccCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCCA < Xen14_168/590‑519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |