| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_124 | = 2576 | 0 (0.000) | 35 (0.420) +CCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACA |
23/240 | 1.6 | 100% | intergenic (+232/–) | sctC_2/– | Type 3 secretion system secretin/– |
| ? | Xen14_21 | 74761 = | NA (NA) | intergenic (+146/–) | hipA/– | Serine/threonine‑protein kinase toxin HipA/– | |||||
AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_124/2432‑2576‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_21/74761‑74837 |||||||||||||||||||||||||||| AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTC < 1:4121729/150‑1AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTC > 1:456571/1‑150 CAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGG < 1:3092739/150‑1 AGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGAATGGTCTTCGGT > 1:2630188/1‑150 GAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTT < 1:3299894/150‑1 GAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTT < 1:3411254/150‑1 AGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGGTGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTT > 1:3163119/1‑150 AGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATAGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTT > 1:1259125/1‑150 AGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCACGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTT > 1:753065/1‑150 ACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCA < 1:4045207/150‑1 CAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGATGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAA‑TTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATC > 1:3883761/1‑150 CAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTCTTCAT > 1:724114/1‑150 AGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATC > 1:1576953/1‑150 GCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCA > 1:2459611/1‑150 GCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGT < 1:313725/150‑1 GCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGA < 1:1319504/150‑1 GCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATA > 1:1537422/1‑150 GCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATA > 1:1537424/1‑150 GCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATA < 1:3151978/150‑1 GCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATA < 1:4243353/150‑1 GCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATA < 1:3150051/150‑1 TTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAAC < 1:224921/150‑1 TTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATATGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAAC < 1:1456600/150‑1 CCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCCATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAG < 1:1964346/150‑1 GCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGC > 1:589167/1‑150 CCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCG > 1:1991895/1‑150 CAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGC < 1:1992826/150‑1 GGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCAT > 1:2550731/1‑150 GGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCAT > 1:1883986/1‑150 CGCTTTTCAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAAT > 1:2092498/1‑150 CGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAAT < 1:334236/150‑1 GCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTT < 1:2036026/120‑1 CTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGT > 1:4026812/1‑150 CTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGT > 1:26422/1‑150 TTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATTTGGCCAGTTGATGAAATTGGTGGGTTACATCAATTCTGGTGATGACTGGCCTGCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTG < 1:3960395/150‑1 TTAAGGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTT > 1:2829109/1‑117 AAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTatatt < 1:3964973/150‑6 GCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTatattatgtt < 1:865595/150‑11 CAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCACAATGgcgttatgtata < 1:1925376/150‑13 AGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTAT < 1:703407/150‑1 AGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTAT < 1:2072384/150‑1 CGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAA < 1:1843108/150‑1 GAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAA > 1:2200744/1‑150 CGAACGACGTAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACG < 1:27215/133‑1 CGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGT > 1:3901932/1‑136 GAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCA < 1:1573445/150‑1 CGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGC > 1:1822720/1‑150 CGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGC > 1:4970/1‑150 ATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGG > 1:1697871/1‑150 GCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCC > 1:1978869/1‑150 CATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATAGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCT < 1:3407351/150‑1 GATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTT < 1:554132/150‑1 GATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTT < 1:554139/150‑1 GGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTACGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACA > 1:1528805/1‑150 GGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCACATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACA > 1:1569695/1‑150 TGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTCTACATAccgcc > 1:3960248/1‑145 TGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGC > 1:2988071/1‑126 TTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAAcgccattgtgcg > 1:1649978/1‑138 TTGATGGGTTACAGCAATTCCGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTGTACAcaacgccattgtgcg > 1:963290/1‑135 ATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGCCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAAcgccattgtgcgcac > 1:542591/1‑135 |||||||||||||||||||||||||||| AGCAGGAGACAGCGCAACGCGCTTCCTGCCAGGCCGCTTTTAAAGGGCAGCTATCGAGACGAACGACGCAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_124/2432‑2576‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_21/74761‑74837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |