| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_159 | = 729 | 33 (0.290) | 52 (0.540) | 31/296 | 2.0 | 46.6% | intergenic (+397/–) | Xen14_04769/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_60 | = 18896 | 86 (1.120) | intergenic (+512/+385) | Xen14_04101/yeeW | hypothetical protein/Protein YeeW | |||||
TTTTGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGTTGTTCTGCGCCATTATTTTCTGATGATGGCGGTAATAATCTACATGGCTTTGCATTCTGGGGTGGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/580‑798 | ttttGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCg < 1:3526989/150‑1 (MQ=255)ttttGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCg < 1:170919/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCATGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCgtt < 1:3143168/150‑1 (MQ=255) tGGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCgttg < 1:644705/150‑1 (MQ=255) ggCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTGATTATCgttgt > 1:1780554/1‑150 (MQ=255) ggCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCgttgt > 1:3007638/1‑150 (MQ=255) ggCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGgtaa > 1:3267175‑M1/1‑146 (MQ=255) gCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCgttgtt > 1:1437631/1‑150 (MQ=255) gCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCgttgtt < 1:1863740/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |