| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_159 | = 729 | 33 (0.290) | 52 (0.540) | 31/296 | 2.0 | 46.6% | intergenic (+397/–) | Xen14_04769/– | hypothetical protein/– |
| ? | Xen14_60 | = 18896 | 86 (1.120) | intergenic (+512/+385) | Xen14_04101/yeeW | hypothetical protein/Protein YeeW | |||||
GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/584‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT < Xen14_60/18896‑18759 GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAA > 1:3267175/1‑150 GCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAG < 1:1291015/150‑1 GCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAG < 1:1291016/150‑1 GCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAG < 1:1291019/150‑1 GAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAA > 1:1334251/1‑150 GAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAA > 1:1330359/1‑150 CGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGG > 1:270664/1‑150 CGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGG > 1:270666/1‑150 gtcAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGA < 1:3876560/147‑1 GTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGTATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGA > 1:3219392/1‑150 GTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGTATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGA > 1:3870386/1‑150 TAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGC > 1:882390/1‑150 TAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGC > 1:1851397/1‑150 TAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGC > 1:1851396/1‑150 TAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGC > 1:1851393/1‑150 AAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACG > 1:3442507/1‑150 AAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACG < 1:3118033/150‑1 TGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTA > 1:1812320/1‑150 GAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTAT > 1:481725/1‑150 ATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTGGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAACACCGTATTGACGCTTATTTATT < 1:2847816/150‑1 AATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTACGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTCCGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTT > 1:1308890/1‑150 ATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTG < 1:933651/150‑1 TGGTTATTCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACTTGAACGGAACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCGTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCTATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAG < 1:3205327/150‑1 TGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAG < 1:53165/150‑1 TGCTTTCGGTTTGCGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGG < 1:3827068/150‑1 GCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:1073334/150‑1 GCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:1073330/150‑1 GCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTCATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGC < 1:1073333/150‑1 CTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCA < 1:1812589/150‑1 CTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCA < 1:2049992/150‑1 CTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCA < 1:2049993/150‑1 TTTCGTTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAG < 1:3627276/150‑1 GTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAcgc > 1:2280798/1‑147 GTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAcgc > 1:2280794/1‑147 GTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTAcgc > 1:2280793/1‑147 TTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAG > 1:1409448/1‑144 AGTATGGGATCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAACACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAG < 1:2938639/140‑1 AGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGA < 1:179652/150‑1 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGTGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:2628461/150‑1 GTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGTGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAA < 1:2553682/150‑1 CCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGC < 1:2479353/150‑1 CTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCA < 1:2389880/150‑1 CTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCA < 1:2389882/150‑1 AACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGAT < 1:3980547/150‑1 ACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATGTGGCGCAGATA < 1:2067884/150‑1 ggatCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGC < 1:2542497/146‑1 ACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTT > 1:3175317/1‑150 ACCGTGGTGGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACACTT > 1:693747/1‑150 GGCTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCG < 1:1391284/150‑1 GGCTTTAATTATCGGGAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCG < 1:3354380/150‑1 CTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGTAGATACGCTTCCGGATCGAT > 1:2985318/1‑150 CTTTAATTATCGGTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGTACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTACGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT > 1:1146641/1‑150 GGCGATAGAGCGTTAATTGAACATCAAATTGAACAATATAATCAGGCTGTTCAGGCTGCGTATTTGCATCGCCTTAAAATCTGGTTATCCAGTGCTTTCGGTTTGAGTATGGGACCTGAACGGGACCGTGGTGGCTTTAATTATCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_159/584‑729‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAGCGTCAACGGAGCACCGTATTGACGCTTATTTATTGGTGAGAACTACGTTCCATGGCAGGAGTTCGTCAACACGGTTGGAGGGCCATTCCGGCAGTATGCTCAGAATATGGCGCAGATACGCTTCCGGATCGAT < Xen14_60/18896‑18759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |