| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_155 | = 77 | 26 (0.530) | 18 (0.320) +CCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACA |
14/240 | 1.0 | 63.1% | intergenic (–/+72) | –/Xen14_04767 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_198 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAGGACGATTGG > Xen14_198/1‑150 | agttgatgaaattgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAAc > 1:1410028‑M2/73‑150 (MQ=255)agttgatgaaattgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCATTTTTATACATAAc > 1:1410027‑M2/73‑150 (MQ=255) ttgatgaaattgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGc < 1:1524178‑M2/80‑1 (MQ=255) ttgatgaaattgatgggctacagcaattctggtgatgactggcctgcggtttgcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGc < 1:1524177‑M2/80‑1 (MQ=255) atgaaattgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATATATAACGCCAt > 1:1386888‑M2/68‑150 (MQ=255) atgaaattgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCAt > 1:1386887‑M2/68‑150 (MQ=255) tgatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTgcgc > 1:512094‑M2/61‑150 (MQ=255) gatgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCa > 1:2907833‑M2/60‑150 (MQ=255) atgggttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCAc < 1:556992‑M2/92‑1 (MQ=255) gttacagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACtgtt > 1:674739‑M2/55‑150 (MQ=255) cagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTgtgt > 1:1085271‑M2/51‑150 (MQ=255) cagcaattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTgtgt > 1:3377029‑M2/51‑150 (MQ=255) caattctggtgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTAtt < 1:557418‑M2/103‑1 (MQ=255) aattctggtgatgactggccttcggttttcctcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTc > 1:3795933‑M2/47‑150 (MQ=255) tgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCTTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAATGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTg > 1:2644901‑M2/39‑150 (MQ=255) tgatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTg < 1:3029197‑M2/112‑1 (MQ=255) gatgactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGc < 1:1077633‑M2/113‑1 (MQ=255) gactggccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACACAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTc > 1:3284736‑M2/35‑150 (MQ=255) ccttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACATGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTTTTGa > 1:3708708‑M2/29‑150 (MQ=255) cttcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGAt > 1:1197050‑M2/28‑150 (MQ=255) ttcggttttcatcattccggataacaGGGCGCATAATTCGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGAtt < 1:3470119‑M2/124‑1 (MQ=255) tcggttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGAttt < 1:2855411‑M2/125‑1 (MQ=255) gttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTAt > 1:1243281‑M2/23‑150 (MQ=255) gttttcatcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTAt > 1:2461766‑M2/23‑150 (MQ=255) catcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATtgtgt < 1:2183454‑M2/133‑1 (MQ=255) catcagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTGTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATtgtgt < 1:2183453‑M2/133‑1 (MQ=255) cagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGcc > 1:2540232‑M2/15‑150 (MQ=255) cagtcctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGcc > 1:415311‑M2/15‑150 (MQ=255) ggtttatgttggTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTc > 1:2910262/12‑150 (MQ=255) tttatgttggTGCGCATAATGTGACATGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTCTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGAtt < 1:1268809/124‑1 (MQ=18) ctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCACAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAg > 1:1882209‑M2/10‑150 (MQ=255) ctgataacaGTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTAAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCACAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTAATTTTATTGTGTGCCCTCAg > 1:1882208‑M2/10‑150 (MQ=255) tggTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAGGACGAtt < 1:3038217/148‑1 (MQ=255) ggTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAGGACGATTg > 1:1377097/2‑150 (MQ=255) gTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACACCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAGGACGATTgg > 1:2308190/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGCGCATAATGTGACACGCGTTATGTTGAAAAGGCCGCTGCGATACTTTCCACCGCAGCGGCCTTTTTATACATAACGCCATTGTGCGCACTGTTGTGTATTCAGTCGTTGCTTCTGTTGATTTTATTGTGTGCCCTCAGGACGATTGG > Xen14_198/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |