| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_155 | = 77 | 26 (0.530) | 18 (0.320) +CCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACA |
14/240 | 1.0 | 63.1% | intergenic (–/+72) | –/Xen14_04767 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_198 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGTTA > Xen14_155/1‑224 | gagacgaacgacgcAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATGATGTATATTATGTTAAATTTAGt > 1:3510633/14‑150 (MQ=18)gagacgaacgacgcAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGt < 1:384571/137‑1 (MQ=255) gacgaacgacgcAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATAGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAg < 1:2801345/136‑1 (MQ=21) acgaacgacgcAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGACGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTccg < 1:939355/140‑1 (MQ=255) acgacgcAAGGCGTGTGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGt > 1:3301678/7‑150 (MQ=255) tGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCAt < 1:449930/150‑1 (MQ=255) aTGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGATTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCcac > 1:1551008/1‑150 (MQ=255) ttGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACt > 1:1502712/1‑150 (MQ=255) gATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTAc > 1:165045/1‑150 (MQ=255) gATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTAc > 1:165046/1‑150 (MQ=255) gtgGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGCTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTccgcc > 1:141766/1‑115 (MQ=255) aGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataac > 1:1410028‑M1/1‑44 (MQ=255) aGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcatttttatacataac > 1:1410027‑M1/1‑44 (MQ=255) gTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCAt < 1:2154792/150‑1 (MQ=255) gTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCAt < 1:530114/150‑1 (MQ=255) ttGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgc < 1:1524178‑M1/150‑109 (MQ=255) ttGATGAAATTGATGGGCTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGcctgcggtttgcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgc < 1:1524177‑M1/150‑109 (MQ=255) atgaAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatatataacgccat > 1:1386888‑M1/1‑39 (MQ=255) atgaAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccat > 1:1386887‑M1/1‑39 (MQ=255) 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aaTTCTGGTGATGACTGGccttcggttttcctcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattgtgcgcactgttgtgtattc > 1:3795933‑M1/1‑18 (MQ=255) aaTTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTAtcttct < 1:1495105/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCATTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTAtcttcttc < 1:1983387/150‑1 (MQ=255) tgatgaCTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgctttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataatgccattgtgcgcactgttgtgtattcagtcgttg > 1:2644901‑M1/1‑10 (MQ=255) tgatgaCTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattgtgcgcactgttgtgtattcagtcgttg < 1:3029197‑M1/150‑141 (MQ=255) gatgaCTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacataacgccattgtgcgcactgttgtgtattcagtcgttgc < 1:1077633‑M1/150‑142 (MQ=255) gaCTGGccttcggttttcatcagtcctgataacagtgcgcataatgtgacacgcgttatgttgaaaaggccgctgcgatactttccaccgcagcggcctttttatacacaacgccattgtgcgcactgttgtgtattcagtcgttgcttc > 1:3284736‑M1/1‑6 (MQ=255) gaCTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACg < 1:2671106/150‑1 (MQ=255) gaCTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACg < 1:2671107/150‑1 (MQ=255) aCTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGCCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTAGCTATCCCTCTATCTTCTTCTTACATGACGt > 1:2678653/1‑150 (MQ=255) cTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGtt > 1:424781/1‑150 (MQ=255) cTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGtt > 1:716650/1‑150 (MQ=255) tGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGTTa > 1:2387768/1‑150 (MQ=255) tGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGTTa > 1:2387767/1‑150 (MQ=255) tGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGTTa > 1:2387766/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CAAGGCGTGAGTCGTCCATGCATTGATGTGGCCAGTTGATGAAATTGATGGGTTACAGCAATTCTGGTGATGACTGGTCTTCGGTTTTCATCAGTCCTGATAACAGTGCGCATAATGTATATTATGTTAAATTTAGTCCGCCGTTCATTTAGTTCATAACCAGCCACAGACTACGATCAATCATACACTTACCTATCCCTCTATCTTCTTCTTGCATGACGTTA > Xen14_155/1‑224 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |