| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_19 | 57504 = | 16 (0.120) | 100 (0.790) | 62/278 | 0.9 | 91.3% | intergenic (‑120/+361) | fimA_2/Xen14_02204 | Type‑1 fimbrial protein, A chain/ISKra4 family transposase ISCep1 |
| ? | Xen14_19 | 57818 = | 4 (0.030) | intergenic (‑434/+47) | fimA_2/Xen14_02204 | Type‑1 fimbrial protein, A chain/ISKra4 family transposase ISCep1 | |||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAGGAAGTTGCGTCGAG > Xen14_19/57356‑57653 | acaacGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACAttt > 1:911178/1‑150 (MQ=255) acGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTggg < 1:442303/150‑1 (MQ=255) acGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTggg > 1:1614333/1‑150 (MQ=255) cGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTgggg > 1:3652123/1‑150 (MQ=255) tGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGCTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAa > 1:2516532‑M1/1‑149 (MQ=255) tGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACCATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGCTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAa > 1:2596642‑M1/1‑149 (MQ=255) gCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAac < 1:742958‑M1/150‑3 (MQ=255) ccAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAact > 1:2713826‑M1/1‑147 (MQ=255) gttataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTg < 1:2158663‑M1/14‑1 (MQ=255) agagTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAactgt < 1:1181651‑M1/150‑6 (MQ=255) gagTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTTAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtc < 1:1315361‑M1/150‑7 (MQ=255) gagTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtc < 1:3522631‑M1/150‑7 (MQ=255) gagTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtc < 1:3437219‑M1/150‑7 (MQ=255) agTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtct < 1:626137‑M1/150‑8 (MQ=255) ataccgccagtaatgctgctcgttttgcctgattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagataagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagataaTTGGGGCCATTTTGACt > 1:3459614‑M1/134‑150 (MQ=255) ataccgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACt > 1:1595769‑M1/134‑150 (MQ=255) ttAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatat > 1:819366‑M1/1‑139 (MQ=255) cnccggtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATa < 1:3145571‑M1/21‑1 (MQ=255) cgccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATa < 1:1065313‑M1/21‑1 (MQ=255) gccagtaatgctgctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATag < 1:1405521‑M1/22‑1 (MQ=255) ttttCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcata > 1:194553‑M1/1‑135 (MQ=255) ttttCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcata > 1:194555‑M1/1‑135 (MQ=255) ttttCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcata > 1:95588‑M1/1‑135 (MQ=255) cATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaata < 1:550916‑M1/150‑20 (MQ=255) tgctgcTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataag < 1:2632815‑M1/150‑22 (MQ=255) gctgctTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGACAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagt < 1:471197‑M1/150‑23 (MQ=255) gctcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATcg < 1:510642‑M1/34‑1 (MQ=255) tcgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttacaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATcgcg < 1:3734821‑M1/36‑1 (MQ=255) cgttttgccggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCgcgc > 1:1829044‑M1/114‑150 (MQ=255) tttAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtatttt > 1:3405973‑M1/1‑118 (MQ=255) tAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtatttttt > 1:1005361‑M1/1‑116 (MQ=255) tAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtatttttt > 1:1005357‑M1/1‑116 (MQ=255) aaaaaaaCTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTggg < 1:1136304/111‑1 (MQ=255) cggattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACtt < 1:1362264‑M1/45‑1 (MQ=255) aaaaaaCTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAAAATTTGGGGCCactgtttatctcataaataagttccgtctttttttc > 1:2610050‑M1/1‑114 (MQ=255) aaaaaCTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctc < 1:1677366‑M1/150‑38 (MQ=255) gattatgggaaagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACtttt > 1:539692‑M1/104‑150 (MQ=255) aaaaCTATATCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTGTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctca > 1:3554298‑M1/1‑112 (MQ=255) tttCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataa > 1:2389926‑M1/1‑105 (MQ=255) tCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCATAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaa < 1:2094029‑M1/150‑48 (MQ=255) aagaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTAtt > 1:817163‑M1/94‑150 (MQ=255) tAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATGTGGGGCCAaactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcat > 1:127604‑M1/1‑101 (MQ=255) gaaataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATttg < 1:674094‑M1/59‑1 (MQ=255) tCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatatta < 1:1214026‑M1/150‑54 (MQ=255) tCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtatttcttctcaagcataaaaatatta < 1:1949656‑M1/150‑54 (MQ=255) tCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTNGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatatta < 1:3568835‑M1/150‑54 (MQ=255) ataatctcataaacgaaagagtaaaaagagaagaggcttgattgaacttattaggaataaagtgaaaaaacaaataagtacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATttgttg > 1:2969646‑M1/89‑150 (MQ=255) ataatctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATttgttg > 1:2049937‑M1/89‑150 (MQ=255) cGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatatta > 1:2421576‑M1/1‑96 (MQ=255) cGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatatta > 1:1407080‑M1/1‑96 (MQ=255) atctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCt < 1:3668119‑M1/65‑1 (MQ=255) cATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaa < 1:2964153‑M1/150‑58 (MQ=255) ctcataaacgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTa < 1:1888429‑M1/67‑1 (MQ=255) cAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCTCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgaca > 1:319636‑M1/1‑87 (MQ=255) acgaaaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCt < 1:2794836‑M1/74‑1 (MQ=255) aaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAg > 1:463012‑M1/73‑150 (MQ=255) aaaattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAg > 1:463008‑M1/73‑150 (MQ=255) aattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGtt < 1:1765670‑M1/80‑1 (MQ=255) aattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGtt < 1:1765675‑M1/80‑1 (MQ=255) aattaaaaagagaagaagcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGtt < 1:1765667‑M1/80‑1 (MQ=255) cacTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaac > 1:851282‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactg > 1:3048869‑M1/1‑72 (MQ=255) tttgtCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgat < 1:571933‑M1/150‑85 (MQ=255) agaagcttgatttaacttattcataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCCTTTTGACCCCTAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCt < 1:151468‑M1/65‑1 (MQ=255) ttgtCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAg < 1:1694002/150‑1 (MQ=255) ttgtCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAg < 1:1693998/150‑1 (MQ=255) gcttgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGttt < 1:3345508‑M1/97‑1 (MQ=255) cAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCC‑TTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGttttt < 1:2642162/150‑1 (MQ=255) tgatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGtttttt > 1:308488‑M1/51‑150 (MQ=255) aCGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaa < 1:2654154‑M1/150‑92 (MQ=255) gatttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTta > 1:869885‑M1/50‑150 (MQ=255) atttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTtat < 1:374915‑M1/102‑1 (MQ=255) tttaacttattaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTtata > 1:1007971‑M1/48‑150 (MQ=255) aGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgac > 1:2303473‑M1/1‑56 (MQ=255) aGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgac > 1:2228511‑M1/1‑56 (MQ=255) aGTTTGACTGCCAACACTGCACAGCTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaatta < 1:1175537‑M1/150‑95 (MQ=255) tGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttc < 1:3716956‑M1/150‑99 (MQ=255) ttaataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAg > 1:208061‑M1/39‑150 (MQ=255) gCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttg > 1:90707‑M1/1‑47 (MQ=255) taataataaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATTTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAgg < 1:1052653‑M1/113‑1 (MQ=255) acacTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaa < 1:2810123‑M1/150‑108 (MQ=255) acacTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaa < 1:2145263‑M1/150‑108 (MQ=255) taaagttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATACTGCATGAGGTGGttt < 1:3833519‑M1/119‑1 (MQ=255) gCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaat < 1:2080143‑M1/150‑113 (MQ=255) gCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactg < 1:363144‑M1/116‑79 (MQ=255) gttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTgg > 1:1034824‑M1/28‑150 (MQ=255) gttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTgg > 1:1034816‑M1/28‑150 (MQ=255) ttaaaaaacaaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGga > 1:2857246‑M1/27‑150 (MQ=255) caGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttc > 1:3242304‑M1/1‑35 (MQ=255) caGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtctatatcatagataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaattt < 1:1457723‑M1/150‑116 (MQ=255) caGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCAaactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaattt < 1:1457719‑M1/150‑116 (MQ=255) gTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcac < 1:2713033‑M1/150‑118 (MQ=255) tttCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcacat < 1:2035823‑M1/150‑120 (MQ=255) caaataaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTAGTTTTTGGAGAgaagaa < 1:649076‑M1/132‑1 (MQ=255) taaatacaagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAg > 1:1602575‑M1/15‑150 (MQ=255) aGATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcacatcacctccgcta < 1:532958‑M1/150‑131 (MQ=255) gATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcacatcacctccgctat > 1:2290476‑M1/1‑19 (MQ=255) gATGAAACATTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcacatcacctccgctat > 1:486656‑M1/1‑19 (MQ=255) caagacaaTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGTATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAGGAAGtt < 1:3378408‑M1/142‑1 (MQ=255) aTTTGGGGCCactgtctatatcataaataagttacgtattttttctcaagcataaaaatattaaaaaacgacaaaaagcatctaactgtttgatatgtaaattatttctcttgtaaattaatttcacatcac < 1:2429780‑M1/133‑123 (MQ=255) | ACAACGATTGCCAGAGTTTTAATTTTCATGCTGCTTTCCTTTAAAAAAACTATTTCTAAATCGACATGGGCAGTCGTTCTGTACACTTTGTTTTGTCAACGAGTTTGACTGCCAACACTGCACAGTTTTCCCCCAAAAGATGAAACATTTGGGGCCATTTTGACTCATAGAGGAAAGCATCGCGCACAAACTTTTTCAGTTTATTTGTTGGCTTAATGTTCTATAGTTATCTTTATTTGCAGTTTTTTATATTGCATGAGGTGGTTTTTGGAGAGAAGAATGAGGAAGTTGCGTCGAG > Xen14_19/57356‑57653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |