Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_004302	22923	22956	34	2 [1]	[1] 3	r1tp40	ORF40

GTCGGCAGGGAATAGTGCAGGGTTAAAAATTGGTTCTGCCTTAAAGGTCGCCGCAATAGCTGGTGTGGTAGCAACAGGAGCAGCACT  >  NC_004302/22938‑23024                    |                                                                    ttcgcaggggAATAGTGCAGGGTTAAAAATTGGTTCTGCCTTAAAGGTCGCCGCAATAGCTGGTGTGGTAGCAAc              >  1:270222/8‑75 (MQ=255)             tgtgaatgggTTAAAAATTGGTTCTGCCTTAAAGGTCGCCGCAATAGCTGGTGTGGTAGCAACAGGAGCAGCACt  >  1:3212639/8‑75 (MQ=255)             ctgtaccgggTTAAAAATTGGTTCTGCCTTAAAGGTCGCCGCAATAGCTGGTGTGGTAGCAACAGGAGCAGCACt  >  1:5335953/8‑75 (MQ=255)                    |                                                                    GTCGGCAGGGAATAGTGCAGGGTTAAAAATTGGTTCTGCCTTAAAGGTCGCCGCAATAGCTGGTGTGGTAGCAACAGGAGCAGCACT  >  NC_004302/22938‑23024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑