| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NODE_26 | 7,555 | Δ2,934 bp | EcoliAnna_03163–[tolC_2] | EcoliAnna_03163, tetR(A), tet(A), tetC, [tolC_2] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NODE_26 | 7555 | 10488 | 2934 | 273 [0] | [3] 274 | EcoliAnna_03163–[tolC_2] | EcoliAnna_03163,tetR(A),tet(A),tetC,[tolC_2] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_26 | = 7554 | 0 (0.000) | 259 (1.010) | 160/278 | 0.1 | 99.4% | intergenic (‑22/‑122) | tolC_1/EcoliAnna_03163 | outer membrane channel protein TolC/hypothetical protein |
| ? | NODE_26 | 10489 = | 3 (0.010) | coding (503/609 nt) | tolC_2 | outer membrane channel protein TolC | |||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
AGCGCAGCCAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCTGATGAATCCCCTAATGATTTTGGTAAAAATCATTAAGTTAAGGTGGATACACATCTTGTCATATGATCCCGGATCTATGATTCCCTTTGTCAACAGCAATGGATCACTGAAAATGGTTCAATGATCACATTAAGTGGTATTCAATATT > NODE_26/7405‑7703 | aGCGCAGCCAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCC > 2:3297180‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCa > 1:302886‑M1/1‑149 (MQ=255) aGCCAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgtt > 2:1833628‑M1/1‑145 (MQ=255) gCCAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgtta < 2:2240504‑M1/150‑7 (MQ=255) ccAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaa > 2:2618165‑M1/1‑143 (MQ=255) ccAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCaagttaa > 1:1757162‑M1/1‑143 (MQ=255) cAGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGGTCGCTACCAGGCCCacgttaaa > 2:3610420‑M1/1‑142 (MQ=255) aGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCTCGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaa > 1:1455802‑M1/1‑141 (MQ=255) aGTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaa > 2:857240‑M1/1‑141 (MQ=255) gTTCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaac > 1:797160‑M1/1‑140 (MQ=255) tCCGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgt < 1:3495211‑M1/150‑13 (MQ=255) ccGGATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgtt < 1:3844724‑M1/150‑14 (MQ=255) ggATAGTAGTTACCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgg > 2:2374480‑M1/1‑135 (MQ=255) 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aCCGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatc > 2:691421‑M1/1‑124 (MQ=255) cGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatcta > 1:3815113‑M1/1‑122 (MQ=255) cGGTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatcta < 2:1649840‑M1/150‑29 (MQ=255) ggTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgataaaacgttgggtggtttgatctaa > 2:1063462‑M1/1‑121 (MQ=255) gTGATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaat > 2:1481290‑M1/1‑120 (MQ=255) tGATCTGGCGCATCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaatt < 2:3903902‑M1/150‑32 (MQ=255) gATCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattg > 2:1149799‑M1/1‑118 (MQ=255) gATCTGGCGCAGCTGCACTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtatgatctaattg < 1:849611‑M1/150‑33 (MQ=255) aTCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattga < 1:2693780‑M1/150‑34 (MQ=255) tCTGGCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgac < 1:3701129‑M1/150‑35 (MQ=255) cTGGCCCAGCTCCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacg < 1:1696956‑M1/150‑36 (MQ=255) ggCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggt < 1:3238985‑M1/150‑38 (MQ=255) ggCGCAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggt > 2:1024079‑M1/1‑113 (MQ=255) cgcAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTGCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtag < 1:2786679‑M1/150‑40 (MQ=255) gcAGCTGCTCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGGGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtaga > 1:1464136‑M1/1‑110 (MQ=255) gctgctCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcg > 1:2538671‑M1/1‑107 (MQ=255) gctCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgctt > 2:608454‑M1/1‑104 (MQ=255) gctCTACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgctt > 1:3480190‑M1/1‑104 (MQ=255) tctACCGGGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttct < 2:1736868‑M1/150‑49 (MQ=255) tACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttcttt > 2:1406548‑M1/1‑100 (MQ=255) tACCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttcttt < 1:458303‑M1/150‑51 (MQ=255) aCCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttctttt > 2:3135344‑M1/1‑99 (MQ=255) aCCGCGTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttctttt < 2:1794787‑M1/150‑52 (MQ=255) cgcgTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttctttttg > 1:500347‑M1/1‑97 (MQ=255) gTTATCAAGGTTATTACGTGCGGTCACTTCGTTCGCCAGCACGGTATCGTACTGTGCGCGGGCGTTCTGCACGTCGGTGATCGCTACCAGGCCCacgttaaaacgttgggtggtttgatctaattgacggtagatcgcttctttttgtgc > 2:3476356‑M1/1‑94 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |