| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 926371 | 52 (0.770) | 8 (0.130) | 6/426 | 4.5 | 13.8% | intergenic (‑166/+361) | unknown/unknown | Soluble lytic murein transglycosylase (EC 4.2.2.n1)/YciL protein |
| ? | 1 | = 926650 | 51 (0.810) | intergenic (‑445/+82) | unknown/unknown | Soluble lytic murein transglycosylase (EC 4.2.2.n1)/YciL protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTCCTCCGTTTACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGATCCTGTGCTGCCCAGTCTTTTGCGGCTTGCAGGCTATCAAATTGTGCGATGACGGTGGAGCCTGAAAAACCCGCGTCGCCCGGGTTTTCATCATCAATT > 1/926402‑926894 | cTTCCTCCGTTTACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCaa < 1:9093/251‑1 (MQ=255)cTTCCTCCGTTTACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCaa < 1:293788/251‑1 (MQ=255) ctccGTTTACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGtt > 1:582115/1‑251 (MQ=255) gTTTACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGa > 1:621351/1‑251 (MQ=255) ttACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAAc < 1:312861/251‑1 (MQ=255) ttACGGGGGACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAAc < 1:599304/251‑1 (MQ=255) ggACAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCtgtg > 1:541327/1‑251 (MQ=255) cAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTc < 1:171301/251‑1 (MQ=255) cAAAACGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTc < 1:96823/251‑1 (MQ=255) cGCATTGCGTTTTGAGCGTTGGCTCTGCCAACGACACCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGgag < 1:302301/251‑1 (MQ=255) cGTTGGCTCTGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTg < 1:14758/249‑1 (MQ=255) ctctGCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGc < 1:40998/251‑1 (MQ=255) gCCAACGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCAt > 1:504338/1‑250 (MQ=255) aCGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAG‑TTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTa < 1:295659/251‑1 (MQ=255) cGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTa < 1:640426/251‑1 (MQ=255) cGACCCCAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTa < 1:57996/251‑1 (MQ=255) ccccAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAgc < 1:197576/251‑1 (MQ=255) ccccAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAg > 1:598676/1‑250 (MQ=255) ccccAAAGGGGTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAg > 1:16434/1‑250 (MQ=255) ggggTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGgaga > 1:243944/1‑211 (MQ=255) gggTGAGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTACAATTTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTAtct > 1:156368/1‑250 (MQ=255) aGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAAc < 1:181018/250‑1 (MQ=255) aGCAAGTAAGTTTTCGAACTTGCGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAAc < 1:371400/250‑1 (MQ=255) cGAATAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTa > 1:25599/1‑213 (MQ=255) tAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAAc < 1:243498/251‑1 (MQ=255) tAACGTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAAc < 1:393922/251‑1 (MQ=255) gTGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACgg > 1:458813/1‑249 (MQ=255) tGCCCGAAGGGCGGAAGGGGGGATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGttt > 1:536742/1‑251 (MQ=255) 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gATTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCat < 1:431368/247‑1 (MQ=255) aTTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATAc < 1:640709/250‑1 (MQ=255) aTTTATCTTGATGTTTCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATAc < 1:65902/250‑1 (MQ=255) tttCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACAt < 1:313748/251‑1 (MQ=255) ttCCACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATa < 1:50464/251‑1 (MQ=255) ccACAAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAg < 1:497516/251‑1 (MQ=255) cacaAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAgg > 1:242697/1‑251 (MQ=255) caAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGAt < 1:447730/251‑1 (MQ=255) caAGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGAt < 1:624556/251‑1 (MQ=255) aGATCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGATc > 1:624239/1‑250 (MQ=255) aTCATGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGATCCtg < 1:557096/251‑1 (MQ=255) aTGCTTAAAAATTGAGATTTTGCCCCCTCAGGGCTTCGCCCGGCTCCCCTCGTGAACGAGGGAAGCCAAGTTTTTTTTCTTTTTATATAAATAGTTGCAATGTTTCGAACAGCTGTGGTCGGGAGACGCGGGCTATCTGTTAAATGCCATCTATTAAGCGCTATCTCAAACGCTATTGATTAAAACACTTTCTTAAACGGTTTAACAATCACTTCGCCATATACGCCGGCTTCTACATAAGGATCCTGtgc < 1:40357/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |