| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1818536 | 57 (0.840) | 8 (0.120) | 6/442 | 4.6 | 11.6% | coding (411/1734 nt) | unknown | Efflux ABC transporter for glutathione/L‑cysteine, essential for assembly of bd‑type respiratory oxidases => CydC subunit |
| ? | 1 | = 1818720 | 66 (1.000) | coding (595/1734 nt) | unknown | Efflux ABC transporter for glutathione/L‑cysteine, essential for assembly of bd‑type respiratory oxidases => CydC subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTTCTACCCATCCGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTAACGGCGAGGACAAGGTC > 1/1818295‑1818785 | ttttCTACCCATCCGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATc < 1:403040/251‑1 (MQ=255) aTCCGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAg < 1:8549/251‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAgtgg < 1:282865/251‑1 (MQ=255) cGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAgtgg < 1:184787/251‑1 (MQ=255) cGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTgg > 1:555830/1‑249 (MQ=255) gggCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCtt > 1:128451/1‑251 (MQ=255) ccGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGtttt > 1:307770/1‑251 (MQ=255) tGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTttatt < 1:138615/251‑1 (MQ=255) aCCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGcc > 1:634901/1‑187 (MQ=255) aCCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATc < 1:169197/194‑1 (MQ=255) aCCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTAcc < 1:413118/224‑1 (MQ=255) aaaaGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCgcgc < 1:489034/251‑1 (MQ=255) gTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGtt > 1:366082/1‑251 (MQ=255) aCCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCgg < 1:243836/251‑1 (MQ=255) aCCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCgg < 1:339278/251‑1 (MQ=255) cccATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTttatt > 1:28120/1‑224 (MQ=255) cccATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGt > 1:132102/1‑251 (MQ=255) cATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGttt > 1:469963/1‑251 (MQ=255) cgcgTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGct < 1:381284/251‑1 (MQ=255) cgTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTaa > 1:445918/1‑207 (MQ=255) gtgCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGAt > 1:107369/1‑251 (MQ=255) tgtTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTAc < 1:85478/251‑1 (MQ=255) ccGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAAtt > 1:413781/1‑251 (MQ=255) gCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAg > 1:532724/1‑109 (MQ=255) gCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGgcgc > 1:624410/1‑250 (MQ=255) gctCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCttt > 1:82476/1‑94 (MQ=255) gctCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATcc < 1:364063/203‑1 (MQ=255) ctCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTAccc < 1:444194/250‑1 (MQ=255) ccGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCAAAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATcc > 1:448956/1‑250 (MQ=255) cGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTAcc < 1:405648/248‑1 (MQ=255) cGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACcg < 1:237744/249‑1 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACAt > 1:182617/1‑154 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTAc > 1:576360/1‑157 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGgcgc < 1:586063/163‑1 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTc > 1:356303/1‑210 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACcgcacgca > 1:58854/1‑251 (MQ=255) ttattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACcgcacgca > 1:488385/1‑251 (MQ=255) tattaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGccc < 1:456919/237‑1 (MQ=255) attaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGt > 1:588478/1‑171 (MQ=255) attaAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAAt < 1:23814/251‑1 (MQ=255) ttGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTAtt > 1:74243/1‑251 (MQ=255) ccGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCCCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCACTTTATCGAATTTATTCAg > 1:111723/1‑251 (MQ=255) cGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAgg < 1:386746/251‑1 (MQ=255) cacCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATc > 1:62929/1‑229 (MQ=255) cacCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCgg > 1:554645/1‑251 (MQ=255) acCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACaaa > 1:555385/1‑177 (MQ=255) acCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTAcc > 1:645868/1‑214 (MQ=255) cTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAatt > 1:136949/1‑251 (MQ=255) gCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATc > 1:427578/1‑218 (MQ=255) gCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGc < 1:473833/238‑1 (MQ=255) gCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTg > 1:113258/1‑248 (MQ=255) gCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGc < 1:198975/249‑1 (MQ=255) atCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTaa > 1:156529/1‑250 (MQ=255) gCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTc > 1:395958/1‑216 (MQ=255) tCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTAACGGCGAGGa > 1:256634/1‑250 (MQ=255) tCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTAACGGCGAGGAc < 1:50340/251‑1 (MQ=255) cgcCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTAACGGCGAGGACAAGGTc < 1:428549/251‑1 (MQ=255) | TTTTCTACCCATCCGCCAGCGTACGCGGTTTGGCAATCGGGCGTACCGTGGCGCGCTACCTTGAAAAAGTGGTCACCCATGACGCCACCTTCCGCGTATTGGCAAAACTGCGTGTGCAGGTGTTTGACAAAATCATTCCGTTAAGCCCTGCGCTGCTCAACCGTTATCGTAACAGCGATTTATTAAACCGCTTGGTTGCCGATGTGGACACCCTCGACAGCCTATATCTTCGCCTCATTGCGCCCTTTATCAGCGCCATAGTGGTGATTGCGTTCATTACCTTTGGCTTGAGTTTTATTAATGCCCCGCTCGCGCTGTTTATCGGTTTCACATTACTGGCGCTCTTGCTGGTTATCCCGACGATTTTTTACCATTTGGGTAACAAATTCGGCGCCAAACTTACCCAATCCCGCGCCCTTTACCGCACGCAATTTATCGAATTTATTCAGGCGCAAGCGGAATTATTGCTGTTTAACGGCGAGGACAAGGTC > 1/1818295‑1818785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |