| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1282705 = | 94 (0.830) | 5 (0.050) | 5/428 | 8.0 | 5.2% | intergenic (+143575/+110606) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1282804 = | 91 (0.840) | intergenic (+143674/+110507) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TACCGGACCCGACAGACGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCGAATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTAACAAACAGGGCTCTGTCGGGATGCCGTTGCCGGGGACGATTATTAAAATTGTGGATCCGGAAACCTTGCAGGAATTAGCAACGGGAGAAGACGGGCTAATTTTAATCGGCGGCGGACAAGTGATGAAAGGCTACTTAAACGATGCCGAAAAAACCGCTGACGTCATTGCCGAAA > 1/1282555‑1283037 | tACCGGACCCGACAGACGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGtt > 1:809097/1‑251 (MQ=255)tACCGGACCCGACAGACGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGtt > 1:386463/1‑251 (MQ=255) ggACCCGACAGACGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAg > 1:680766/1‑251 (MQ=255) aGACGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAata > 1:312632/1‑251 (MQ=255) aCGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAatat < 1:879508/250‑1 (MQ=255) cGGTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGc < 1:522558/251‑1 (MQ=255) gTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAatat > 1:1051725/1‑247 (MQ=255) gTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCg > 1:1074681/1‑251 (MQ=255) gTGCTGCAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCg > 1:482751/1‑251 (MQ=255) gcAGTAGGGAAAATGGCAGCGCGCCATAATGCCAGCATTTTGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCGAatat > 1:898438/1‑251 (MQ=255) 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ttGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCGAATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTaacaa > 1:259848/1‑251 (MQ=255) ttGTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCGATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCGAATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTaacaa < 1:118290/251‑1 (MQ=255) gTTCGGCACTTCAACCTTCTTCCGTCTATACAATCGAAATAAAAAATTGCATCCGTTAATGTTCCAGAATATCCGCATGGTGGTTGCCGGCGCGGAAAAACTGAAAGCCGATGTGAAAGAAGCGTTCCGCTTGAAATTCGGTTTAGACATTTACGAAGGCTACGGCACTACGGAAACCGCGCCGGTTGCAGCGGTGAATATGCCGAATATTTTGGAAAAAGAAACGTTAAAAGAGCTGACGTTTaacaaa > 1:706253/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |