| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,143,909 | (CACCT)4→3 | intergenic (+4779/+249398) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1143896 = | 6 (0.050) | 53 (0.510) | 36/410 | 1.7 | 90.2% | intergenic (+4766/+249415) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1143890 | 6 (0.060) | intergenic (+4760/+249421) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTTATAACGGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1144163‑1143896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggtgaggtgaggtgaggCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACGT < 1/1143890‑1143651 TTTATAACGGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCACCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAA < 1:892639/251‑1 ATAACGGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGT < 1:1031097/251‑1 CGGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGG > 1:823550/1‑251 GGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGT > 1:813908/1‑251 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ATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGAT < 1:695355/250‑1 GGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGA > 1:947328/1‑251 GGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGA > 1:207613/1‑251 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GCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTG < 1:217221/248‑1 TTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATC < 1:354836/251‑1 TTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATA < 1:840804/249‑1 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ATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTC < 1:222656/251‑1 ATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTC < 1:330430/251‑1 ATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTC < 1:822379/251‑1 CCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTAATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCACCCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGATTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATAC < 1:1003351/251‑1 GAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAG > 1:1086200/1‑231 GAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTT < 1:134734/190‑1 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATG > 1:693938/1‑251 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATG > 1:410847/1‑251 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATG > 1:510376/1‑251 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCAT < 1:292608/250‑1 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCT > 1:372292/1‑198 GATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCA < 1:755257/35‑1 ATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTACCCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCAT < 1:627831/249‑1 TATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGC > 1:1068105/1‑250 GTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCC < 1:951516/91‑1 TGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGC < 1:539200/251‑1 GGTGAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGAT > 1:364761/1‑62 GAGGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCC > 1:392534/1‑79 GGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACG > 1:923349/1‑251 GGTGAGGTGAGGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGAT < 1:732449/139‑1 GGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACGT > 1:222600/1‑242 GGCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACC < 1:733572/148‑1 TTTATAACGGCGTTGGCTGATAAAATCGCCGTTGTCGTAATAGCGGGAAAAGAAAGTGAAAAGATGGTTATAAACTGCCGTTTCTTGCTCGGCATTGCTCGCCAATGCAGTTTGAATTTTTTGAGGAAGTGTGGTTTCAAGAAAGGTGGCAATTTCCGCAGCGCGGGAATTTAAAATGCGATAAATACCGAAATCCAGCTCCGGTTGATTAATTTGAAAAATTTCCTTGAGTTTAGATATAAGTTGTGCAAGGTGAGGTGAGGTGAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1144163‑1143896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aggtgaggtgaggtgaggCATATTTTTTTCCTTTTAAAATCTAGCTGTCAAGTTATTTTTGATGGAATATGGTGTTTATATCCTATGTAAAAGAGCGGTCAAAACACTATGAATTTTGACCGCTCTTTTAGATTAAAAATTAGATCGAACGTTTAACCTCAACCACTTCAAACACTTCAATCTGGTCGCCGACTTTCACATCGTTGTAGTTCTTCACGCCGATACCGCATTCCATGCCGTTACGCACTTCGGAAACGT < 1/1143890‑1143651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |