| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1854493 = | 36 (0.290) | 4 (0.030) | 4/420 | 9.1 | 14.8% | intergenic (+44428/‑94960) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC |
| ? | 1 | 1854932 = | 12 (0.100) | intergenic (+44867/‑94521) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAA/tRNA‑Asp‑GTC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AACTTCAAGTTTTCCTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAACAATGTTATCAAAGAAAAAAATATGCCTAATAAAATAAAATTTGTTTCTGGAAATTTTGAAAATAAAACAATTTGTCTAAATTGTTCTATGT > 1/1854718‑1855132 | aaCTTCAAGTTTTCCTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAatta < 1:830451/251‑1 (MQ=255) ccTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCAt < 1:1184594/223‑1 (MQ=255) ccTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCAt > 1:324856/1‑251 (MQ=255) ccTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCAt > 1:911171/1‑251 (MQ=255) gTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAatt > 1:821598/1‑227 (MQ=255) tttAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTAc < 1:335733/251‑1 (MQ=255) aaTTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAat < 1:491598/249‑1 (MQ=255) gTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCAt > 1:287814/1‑192 (MQ=255) gTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAAc > 1:959595/1‑248 (MQ=255) gTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAACAAt > 1:946277/1‑251 (MQ=255) ttAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAACAATGTTATCAAAGAAAAAAATATGCCTAATAAAATAAAATTTGTTTCTGGAAATTTTGAAAATAAAACAATTTGTCTAAATTGTTCtatgt < 1:938805/251‑1 (MQ=255) tttATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTc > 1:65817/1‑115 (MQ=255) ccATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAACAATGTTATCa > 1:888774/1‑128 (MQ=255) | AACTTCAAGTTTTCCTTTATATGGTTTTAGAATTCCACAGATAAGTTTTAGTAGTGTAGATTTTCCTGAGCCATTAGTACCAATCAATCCCCAAGATTCACCCTTTTTAACTTTAAAAGAAACATCATTTAATGATAAAAATTCTTGGAACATTAACTTTCCTTTTAGCATTTTTATAATGTAGTCTTTTAAGCCGCTATAATTTTCCATTGCTTTATTAAAGCGAACAGTAGCATTTTCAACGTTAATTATTTCTGTATTCATAGCTATATGTACAATATAAATTCATCTTGTTTCTTGTTAAAATACCAAGTACCTAAAAACAATGTTATCAAAGAAAAAAATATGCCTAATAAAATAAAATTTGTTTCTGGAAATTTTGAAAATAAAACAATTTGTCTAAATTGTTCTATGT > 1/1854718‑1855132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |