| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 16273 = | 67 (0.540) | 7 (0.060) | 4/430 | 9.2 | 10.3% | intergenic (–/‑81819) | –/unknown | –/tRNA‑Pseudo‑??? |
| ? | 1 | 16690 = | 57 (0.470) | intergenic (–/‑81402) | –/unknown | –/tRNA‑Pseudo‑??? | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGCGTATTCACGACGCTTACGTCAAAAAACTTAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCACCAGCTCGTGTGTTCATCTGTATGATTCCTACGTTTTAAAAGAAGGTAAACGAGAAAGCAATATC > 1/16446‑16933 | tGCGTATTCACGACGCTTACGTCAAAAAACTTAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCg > 1:218636/1‑251 (MQ=255) gTATTCACGACGCTTACGTCAAAAAACTTAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCggg < 1:1149339/250‑1 (MQ=255) aaaCTTAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAg < 1:745464/241‑1 (MQ=255) ttAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAAttt < 1:529721/251‑1 (MQ=255) aTGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGga < 1:533963/251‑1 (MQ=255) aaGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGgaag < 1:1113077/250‑1 (MQ=255) caAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGAt < 1:528120/251‑1 (MQ=255) gatTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGga > 1:173676/1‑220 (MQ=255) atTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGtt < 1:672288/251‑1 (MQ=255) cGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAAc > 1:1147620/1‑250 (MQ=255) aTGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCg > 1:712304/1‑251 (MQ=255) ttAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATaa > 1:431954/1‑250 (MQ=255) gTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTAt < 1:821930/250‑1 (MQ=255) cacCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATAc > 1:908960/1‑250 (MQ=255) ccTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGCTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCg > 1:484766/1‑250 (MQ=255) aTGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGAc < 1:181307/251‑1 (MQ=255) cATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCAt > 1:1190038/1‑251 (MQ=255) atgaATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAGAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATcc < 1:1087894/250‑1 (MQ=255) aTTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAg > 1:812025/1‑250 (MQ=255) ttCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGt < 1:912580/169‑1 (MQ=255) cATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACaaaa > 1:818034/1‑251 (MQ=255) aTCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACaaaaa < 1:224789/251‑1 (MQ=255) ctctATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAg < 1:731125/251‑1 (MQ=255) gTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATcc > 1:712689/1‑223 (MQ=255) gTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGc < 1:412369/228‑1 (MQ=255) gTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACg > 1:62568/1‑251 (MQ=255) gTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACg > 1:802295/1‑251 (MQ=255) tATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATAc < 1:1123771/187‑1 (MQ=255) aTTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGc < 1:511775/218‑1 (MQ=255) aaGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCAcc < 1:418376/251‑1 (MQ=255) gAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAAGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACaaaaa > 1:311996/1‑221 (MQ=255) aaaTTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCACCAg < 1:781461/250‑1 (MQ=255) cAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTAc < 1:526679/145‑1 (MQ=255) gTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGtt > 1:643611/1‑121 (MQ=255) gTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAg > 1:265563/1‑157 (MQ=255) gTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGc > 1:743431/1‑201 (MQ=255) gTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCACCAGCTCGTGTGtt > 1:807085/1‑251 (MQ=255) 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tttATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCACCAGCTCGTGTGTTCATCTGTATGATTCCTACGTTTTAAAAGAAGGTAAACGAGAAAGCAATATc < 1:574092/251‑1 (MQ=255) | TGCGTATTCACGACGCTTACGTCAAAAAACTTAATGAAGCACAAGAAATCGACTTCGATGATATGATTTTGCAAGCGACTATGCTAATTAAAAACGGTAGCTTTACACCTAAATGGAAGCATATTCTTGTTGATGAATTCCAAGACATCTCTATGGCGCGTTTAGAGCTATTAAAAGAAATTTACAGTAAAGGACCGCGCCCTATTTGGACAGTGGTAGGCGATGACTGGCAATCTATTTATCGTTTTTCGGGTGGTAAGTTAGAAGTGACCACACAATTTGGAAGAATGATTGGTTCCCACACGTTAAGTAAGTTAGAGAAAACCTACCGCTATAACAATAGTATTGCAAATACCGCAGGACGCTTCATTATGCAAAATCCTGAGCAATACAAAAAAGATATCGAAACGCATACTCAAGTCACCAGCTCGTGTGTTCATCTGTATGATTCCTACGTTTTAAAAGAAGGTAAACGAGAAAGCAATATC > 1/16446‑16933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |