| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,420,817 | (TGCCT)6→5 | intergenic (+189/‑63) | unknown → / → unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1420790 | 1420794 | 5 | 40 [0] | [0] 40 | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1420795 = | 0 (0.000) | 36 (0.470) | 30/376 | 1.3 | 100% | intergenic (+167/‑89) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1420789 | 0 (0.000) | intergenic (+161/‑95) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAAC > 1/1420551‑1421034 | ttCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCATTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgcct > 1:483973‑M2/1‑239 (MQ=255) aCATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaacta > 1:109985‑M2/1‑217 (MQ=255) ttattGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaa < 1:762537‑M2/251‑73 (MQ=255) gCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggag < 1:651693‑M2/251‑85 (MQ=255) 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cAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaa < 1:542583‑M2/251‑225 (MQ=255) aCCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatc > 1:441213‑M2/1‑25 (MQ=255) aCCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaat < 1:542898‑M2/250‑226 (MQ=255) 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(MQ=255) ggAGTAAAAAATATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaact > 1:885899‑M2/1‑15 (MQ=255) aaaaTATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaac > 1:870213‑M2/1‑8 (MQ=255) aaTATGcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgttaattgcaagcaaaatctatcacttttcttaaaaatttattcggaggataaatgatctccgaagaacttttctctcgtgacggcgtttccgctaactctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagcc > 1:305433‑M2/1‑6 (MQ=255) | TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAAC > 1/1420551‑1421034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |