| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,420,817 | (TGCCT)6→5 | intergenic (+189/‑63) | unknown → / → unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1420790 | 1420794 | 5 | 40 [0] | [0] 40 | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1420795 = | 0 (0.000) | 36 (0.470) | 30/376 | 1.3 | 100% | intergenic (+167/‑89) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | = 1420789 | 0 (0.000) | intergenic (+161/‑95) | unknown/unknown | Threonyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.3)/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
CGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCC > 1/1420556‑1421039 | ttcaccgtggaagaatttttagacattctgaaaaaacaagtgagaaatcgcgaattgaaattattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccattaataggagtaaaaaatatgcttgccttgcct > 1:483973‑M1/240‑251 (MQ=255) acattctgaaaaaacaagtgagaaatcgcgaattgaaattattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaacta > 1:109985‑M1/218‑250 (MQ=255) ttattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTaaaa < 1:762537‑M1/72‑1 (MQ=255) gcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaact > 1:563741‑M1/168‑199 (MQ=255) 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accagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATc > 1:441213‑M1/26‑251 (MQ=255) ccagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTttatt < 1:858580‑M1/211‑1 (MQ=255) ccagtaataggagtaaaaaatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAAt < 1:469339‑M1/225‑1 (MQ=255) 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aatatgCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGcc > 1:305433‑M1/7‑251 (MQ=255) | CGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCC > 1/1420556‑1421039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |