| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 293,098 | Δ19 bp | intergenic (‑25738/+51489) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 293098 | 293116 | 19 | 85 [0] | [0] 85 | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 293097 | 0 (0.000) | 85 (0.960) | 59/430 | 0.3 | 100% | intergenic (‑25737/+51508) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | 293117 = | 0 (0.000) | intergenic (‑25757/+51488) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
AATTCGTGTTTTACACACCGATCCGCAACACGCCAGTCGTTTTGATGTAGCAGAGTTGCCAACATGGAAATTAGATAAGGATTTTCAAAAATTACTCTTCCAATTTCAAGGTATTTTGCCATTGAAAAAATGCTCTAATCTACAATCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGCCATTGAAGCGATTACAACAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGTTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAGAGGG > 1/292874‑293353 | gcgtaggcacaaaagatgcaattcgtgttttacacaccgatccgcaacacgccagtcgttttgatgtagcagagttgccaacatggaaattagataaggattttcaaaaattactcttccaatttcaaggtattttgccattgaaaaaatgctctaatctacaatcgccagagttagcgacaaaaattcatacgatttcagggggtaatttagggaatgtacatcgtttattaaccgcgtgcgAGGAAc < 1:742453‑M2/6‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |