| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 293,098 | Δ19 bp | intergenic (‑25738/+51489) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 293098 | 293116 | 19 | 85 [0] | [0] 85 | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 293097 | 0 (0.000) | 85 (0.960) | 59/430 | 0.3 | 100% | intergenic (‑25737/+51508) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | 293117 = | 0 (0.000) | intergenic (‑25757/+51488) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
GCGTAGGCACAAAAGATGCAATTCGTGTTTTACACACCGATCCGCAACACGCCAGTCGTTTTGATGTAGCAGAGTTGCCAACATGGAAATTAGATAAGGATTTTCAAAAATTACTCTTCCAATTTCAAGGTATTTTGCCATTGAAAAAATGCTCTAATCTACAATCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/292855‑293097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGTTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAGAGGG > 1/293117‑293353 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AATCTACAATCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATT < 1:378683/109‑1 AATCTACAATCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGG‑ACTTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGCGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTAT > 1:222696/1‑117 TCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGC < 1:380631/251‑1 CGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATG > 1:582835/1‑199 TTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTACGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACAT < 1:250189/251‑1 GATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTAC < 1:599331/229‑1 ATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATA > 1:366088/1‑251 ATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGC < 1:341739/221‑1 ATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGAT > 1:68134/1‑208 TCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATCAGT < 1:267585/251‑1 TCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGT < 1:73096/251‑1 GGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTAT < 1:697901/236‑1 GGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGAT < 1:700745/200‑1 ATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGG < 1:246040/83‑1 GGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGC > 1:599779/1‑89 GAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATA < 1:611268/250‑1 GAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTAT > 1:684040/1‑59 ATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGAT > 1:9578/1‑245 TGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGAT < 1:341208/251‑1 GTACATCGTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTAC > 1:275427/1‑192 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGGACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGctc > 1:387289/1‑149 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAG > 1:629132/1‑251 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATA > 1:697876/1‑239 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGAC < 1:339304/229‑1 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTAC > 1:228946/1‑185 GTTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAG > 1:5132/1‑143 TTTATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAGA > 1:646505/1‑251 TATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGA > 1:510887/1‑239 TATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTG > 1:26933/1‑202 TATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGAT < 1:857901/174‑1 ATTAACCGCGTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTATGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGCTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAGAGGG < 1:444956/251‑1 GTGCGAGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTC < 1:164849/47‑1 GCGTAGGCACAAAAGATGCAATTCGTGTTTTACACACCGATCCGCAACACGCCAGTCGTTTTGATGTAGCAGAGTTGCCAACATGGAAATTAGATAAGGATTTTCAAAAATTACTCTTCCAATTTCAAGGTATTTTGCCATTGAAAAAATGCTCTAATCTACAATCGCCAGAGTTAGCGACAAAAATTCATACGATTTCAGGGGGTAATTTAGGGAATGTACATCGTTTATTAACCGCGTGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/292855‑293097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGGAACAGAGCAAATTACATTAGATATTATCGAGCATAATTCATGGGTACAACCAACGCAGGGCTTACGAAAAATTATCGGATAAAATCAAGGATTATTCGAACACCGCTTTACCTCAATGAAAGCATCAGTTCGTGGCTCATTCGTGCCGCCTTAGATTGTGGTACAGAGCCGATTACATTTACTGGATTTTATTGGGATAAGTGGCGACTATGGATATATGATTTAGATAGAGGG > 1/293117‑293353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |