| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 197,628 | 1526 bp→TATTACTACTGCCGGA | intergenic (+64317/+63078) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 197628 | 199153 | 1526 | 118 [0] | [1] 118 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 197627 | 0 (0.000) | 97 (1.190) +TATTACTACTGCCGGA |
74/388 | 0.0 | 99.5% | intergenic (+64316/+64604) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 199154 = | 1 (0.010) | intergenic (+65843/+63077) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GGCATTGGAATTAGCAAAACGTGGTTTCGTTGTTCTTGCAATTGATCATTTTGGTCATGGCTATTCAACTAAATTACCTGCGTCAAATAAAAATATGAGTGGTGCAAATAATGGTTATCAATATTTGAAATCTTTACCTTTTGTAGATAGTCGGCGATTAGGTATTTTTGGTCATTCAACAGGTGCCTTAAATGCTATTCGTGTCGCTCAGTTAAATCCTGATCACAAAGCGATAAATGGTCAAAGTAGTAACGGTGGAGATCCCGGTCTCCATAATTATCTCCTTACTCAGGGATTGTATGAGGAAATAGCCGGTTATCGTGAAAAATCTTTTCCGGTTAAAGAGTTAGCTAAAAATACCAACCGTCTAAAAGCATTTTCATTGGAAAAAAGTGGTGGTTTACAATGGGATCATACTTATGGAAACTTTACTGACGGTTCAGCAAGACGAGTGGCTTTAGTAGAGGGTACTCATTTAGGTGTGATGGTTTCATCA > 1/198905‑199400 | gaaattcttaactcatctttggcaccaattgccgggattatcttaattacaggtgccggcgggatgtttggtaaagttttagatgcaagtggtgtaggaaaggcattggctgaggtactatccggcaccggattacatgttcttacattaggttttgtgctagcagcattattatgcgcagcacaaggttctgcgacagtggcaattattactactgcaacaattctatcgcctattactactgccggaTa > 1:218320‑M2/250‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |