| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,330,189 | (GGTAAGTTG)1→2 | intergenic (+170609/+90748) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 1330173 | 0 (0.000) | 55 (0.650) +TAAGTTGGG |
42/380 | 0.6 | 100% | intergenic (+170593/+90764) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1330174 = | 0 (0.000) | intergenic (+170594/+90763) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
ACACGTCCAAATTATCCCCTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTTAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGCATATTTTTTACTCCTATTACTGGTTGTCAAGTACAAAGTGTACTTTGTTTTATACAATATCGAGTGTTAAAAAGCTGAA > 1/1329925‑1330419 | aattatccccttggattaacagattttggctgttggcattttcaggtttagcgttgtggtttttgtcttcgcaaagtaaagtttcaggcggaagattacgcagcaatttggcataggatttacccaaccagttcatttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggta > 1:67812‑M2/250‑251 (MQ=255) cccttggattaacagattttggctgttggcattttcaggtttagcgttgtggtttttgtcttcgcaaagtaaagtttcaggcggaagattacgcagcaatttggcataggatttacccaaccagttcatttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggtaagttggg > 1:237004‑M2/243‑251 (MQ=255) attttggctgttggcattttcaggtttagcgttgtggtttttgtcttcgcaaagtaaagtttcaggcggaagattacgcagcaatttggcataggatttacccaaccagttcatttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggTAAGTTGGGTAAGTTGTGCag < 1:790374‑M2/21‑1 (MQ=255) attttggctgttggcattttcaggtttagcgttgtggtttttgtcttcgcaaagtaaagtttcaggcggaagattacgcagcaatttggcataggatttacccaaccagttcatttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGt < 1:616888‑M2/24‑1 (MQ=255) 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1:521187‑M2/125‑251 (MQ=255) ttcatttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTTaggc < 1:775374‑M2/133‑1 (MQ=255) ttcgtaaaattcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTTaggcaaggc < 1:402172‑M2/138‑1 (MQ=255) attcacggctgatgtcggcttgttctgcaatttcagattggaatttttctaataaaaattgaccgcttacatcgaaacaattcgggaaaagagctttaagttgggTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTttgct > 1:577519‑M2/106‑215 (MQ=255) 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gctttaagttgggtAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGCATATTTTTTACTCCTATTACTGGTTGTCAAGTACAAAGTGTACTTTGTTTTATACAATATCGAg > 1:275169/14‑234 (MQ=255) | ACACGTCCAAATTATCCCCTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTTAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGCATATTTTTTACTCCTATTACTGGTTGTCAAGTACAAAGTGTACTTTGTTTTATACAATATCGAGTGTTAAAAAGCTGAA > 1/1329925‑1330419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |