| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,330,189 | (GGTAAGTTG)1→2 | intergenic (+170609/+90748) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1330173 | 0 (0.000) | 55 (0.650) +TAAGTTGGG |
42/380 | 0.6 | 100% | intergenic (+170593/+90764) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1330174 = | 0 (0.000) | intergenic (+170594/+90763) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
CGTCCAAATTATCCCCTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTTAAGTTGGGTAAGTTGTGCAGAGTTAGCGGAAACGCCGTCACGAGAGAAAAGTTCTTCGGAGATCATTTATCCTCCGAATAAATTTTTAAGAAAAGTGATAGATTTTGCTTGCAATTAACGTTTAGTTTAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGGCAAGCATATTTTTTACTCCTATTACTGGTTGTCAAGTACAAAGTGTACTTTGTTTTATACAATA > 1/1329928‑1330399 | cGTCCAAATTATCCCCTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagt < 1:164735‑M1/251‑6 (MQ=255) aaTTATCCCCTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggta > 1:67812‑M1/1‑240 (MQ=255) cccTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttggg > 1:237004‑M1/1‑233 (MQ=255) ccTTGGATTAACAGATTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagtt < 1:758443‑M1/238‑7 (MQ=255) aTTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagt < 1:616888‑M1/251‑34 (MQ=255) aTTTTGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcag < 1:790374‑M1/248‑31 (MQ=255) ttttGGCTGTTGGCATTTTCAGGTTTAGCGTTGTGGTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagt > 1:782497‑M1/1‑217 (MQ=255) 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ggTTTTTGTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcgga > 1:778370‑M1/1‑183 (MQ=255) gTCTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcggaaacgccgtcacgagagaaaagttcttcgg < 1:449322‑M1/245‑70 (MQ=255) cTTCGCAAAGTAAAGTTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcggaaacgccgtcacgagagaaaagttcttcggagatcatt < 1:179432‑M1/251‑78 (MQ=255) aagtaaagtTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcggaaacgccgtcacgagagaaaagttcttcggagatcatttatcctc < 1:617238‑M1/251‑85 (MQ=255) aagtaaagtTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcggaaacgccgtcacgagagaaaagttcttcggagatcatttatcct > 1:631318‑M1/1‑167 (MQ=255) aagtaaagtTTCAGGCGGAAGATTACGCAGCAATTTGGCATAGGATTTACCCAACCAGTTCATTTCGTAAAATTCACGGCTGATGTCGGCTTGTTCTGCAATTTCAGATTGGAATTTTTCTAATAAAAATTGACCGCTTACATCGAAACAATTCGGGAAAAGAGCTTtaagttgggtaagttgggtaagttgtgcagagttagcggaaacgccgtcacgagagaaaagttcttcggagatcatttatcc < 1:817889‑M1/249‑83 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |