| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1137513 | NA (NA) | 14 (0.160) +C |
10/428 | 4.7 | 17.8% | intergenic (+464/‑21991) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | = 1715996 | 65 (0.740) | intergenic (‑46048/‑3887) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑CCG/tRNA‑Asn‑GTT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCAGAAAATATCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAACCGTGTCACATTTATTGCCGGTAACCGGGT > 1/1715751‑1716246 | gcagAAAATATCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTtat > 1:457490/1‑251 (MQ=255) gAAAATATCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAg > 1:902002/1‑251 (MQ=255) gAAAATATCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGCGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAg > 1:680854/1‑251 (MQ=255) atatCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCa > 1:508918/1‑249 (MQ=255) tcCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGc < 1:639603/251‑1 (MQ=255) gTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCtat > 1:830348/1‑251 (MQ=255) tAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAg < 1:102531/251‑1 (MQ=255) tGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTtata < 1:688753/216‑1 (MQ=255) aTTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCa > 1:634031/1‑248 (MQ=255) ggTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTAttt > 1:659623/1‑251 (MQ=255) gTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTAttt < 1:161368/250‑1 (MQ=255) aaaCAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGa > 1:799518/1‑251 (MQ=255) aaTGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGaaaaa > 1:171108/1‑251 (MQ=255) ggTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAgaga > 1:405244/1‑251 (MQ=255) gTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTc < 1:406453/238‑1 (MQ=255) ttACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATaaaa > 1:456672/1‑251 (MQ=255) gTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAg < 1:261186/190‑1 (MQ=255) gTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAAt > 1:397027/1‑250 (MQ=255) tCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAg < 1:29404/188‑1 (MQ=255) tCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAg > 1:675967/1‑188 (MQ=255) cATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCCCGCTATTGc > 1:427253/1‑179 (MQ=255) gtgATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCaaaaaa > 1:796190/1‑189 (MQ=255) cGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATttatta < 1:660372/251‑1 (MQ=255) tCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc < 1:574269/250‑1 (MQ=255) tCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc < 1:58106/250‑1 (MQ=255) ttacttacCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATtta < 1:198211/237‑1 (MQ=255) acttacCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTc > 1:204055/1‑219 (MQ=255) acttacCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc > 1:561759/1‑224 (MQ=255) gACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc > 1:353334/1‑214 (MQ=255) ctcctATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTAttt > 1:585708/1‑167 (MQ=255) ctcctATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAattat > 1:650646/1‑251 (MQ=255) cctATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTAttt > 1:419869/1‑251 (MQ=255) atCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATAc < 1:803450/191‑1 (MQ=255) aTTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATACAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTa > 1:422916/1‑250 (MQ=255) ttGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTAttc < 1:170375/214‑1 (MQ=255) gCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTAttt > 1:550117/1‑140 (MQ=255) gCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACttatttat > 1:510732/1‑202 (MQ=255) tCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATaa < 1:335876/94‑1 (MQ=255) tCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAg < 1:705160/96‑1 (MQ=255) tCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTAttc < 1:98662/197‑1 (MQ=255) cATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGa > 1:461711/1‑137 (MQ=255) cATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAag > 1:726400/1‑143 (MQ=255) cATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc > 1:637839/1‑186 (MQ=255) cATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACtt < 1:622889/188‑1 (MQ=255) aTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGGCCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGAtt < 1:829794/179‑1 (MQ=255) aTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAAt > 1:665385/1‑108 (MQ=255) aTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAag < 1:524308/142‑1 (MQ=255) aTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTc < 1:609321/165‑1 (MQ=255) aTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGa > 1:317093/1‑177 (MQ=255) ttATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc < 1:684135/184‑1 (MQ=255) atataGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc > 1:538725/1‑167 (MQ=255) atataGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc < 1:171234/167‑1 (MQ=255) ataGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAg > 1:770866/1‑250 (MQ=255) tttttATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGAt > 1:428336/1‑162 (MQ=255) tttATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTACTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATc < 1:260238/251‑1 (MQ=255) cTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCaa > 1:891402/1‑236 (MQ=255) tctTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTTATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAAc < 1:445589/251‑1 (MQ=255) ttCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGcc < 1:98326/81‑1 (MQ=255) tACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc < 1:702197/120‑1 (MQ=255) gCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc > 1:342385/1‑127 (MQ=255) gCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAACCGTGTCACATTTATTGCCgg > 1:407167/1‑251 (MQ=255) gCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAACCGTGTCACATTTATTGCCgg > 1:67940/1‑251 (MQ=255) gTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGc > 1:570062/1‑105 (MQ=255) gTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTAc < 1:52976/120‑1 (MQ=255) ttttATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACATGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAACCGTGTCACATTTATTGCCGGTAACCGGGt > 1:151879/1‑251 (MQ=255) | GCAGAAAATATCTATCCGTTCTAAGCTTTCCGCAAATGGCTTTTCTTCTCTATTTCGGGGTGAAAACAATGTGGTACTTACAGTTCCATTTGGTGTGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTTGGTTGTCAGCCTTATTCATTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGTTTTTATAAGCACGCTATTGCTATAAAGTGCGGTCAAAAAATCAGGTGTTTTTCATGGCCTATTTTCTGAAAAAAGAGATAAAAAAATCTGCATACTTCACAGCATGCAGATTTATTACTTATTTATTCTTCAATTAAAAAGAAATTATTTCGTGCCGTTTACCGCAATTTCTACACGACGGTCATCAGCCAAGCACGCAATCAGCGCTTTGCGACCTTTAACCGTGTCACATTTATTGCCGGTAACCGGGT > 1/1715751‑1716246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |