| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 286401 | 0 (0.000) | 22 (0.280) +TAAACAACCAACTACACGAATA |
8/386 | 4.9 | 32.5% | intergenic (‑19041/+58204) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | = 286784 | 102 (1.160) | intergenic (‑19424/+57821) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTATATAGGTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTAAGGGGATAAAAAGAATTGATAGACCTGAAGAATCAGTTCCTGGCTCCCAATATCATGCCCATGCTTACAATGATGCAGCACTTAATGTAGATGGAACGGTACATGATAAACATCGTGGAATGCCACCATTCTCTAAAGATGATAAAGATTTTCTATTTTGTTACGGCTGGAAAGGAGTATAAAAGATGCAGAGCTTAACA > 1/286534‑287034 | cTATATAGGTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTgg > 1:254150/1‑251 (MQ=255) atataGGTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGGATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGaa > 1:393797/1‑251 (MQ=255) atataGGTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGaa > 1:440949/1‑251 (MQ=255) ggTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCa > 1:396313/1‑251 (MQ=255) ggTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAAAGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAacac > 1:800042/1‑249 (MQ=255) ggTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGGAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGGGAAAAAGAAAGCAAAAGACGGTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCa > 1:180581/1‑251 (MQ=255) gTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACAcc < 1:547890/249‑1 (MQ=255) tGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTc < 1:624682/251‑1 (MQ=255) ggCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAg < 1:638640/249‑1 (MQ=255) cgGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGGATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGa > 1:24132/1‑251 (MQ=255) gTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTTTTGGCGTAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGGATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGGACACCAGCTCAGGCTAGaaa > 1:116059/1‑251 (MQ=255) gTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAAAGCAAAAGACGTTGTAAGAAGGGGGGGACTgggac > 1:405342/1‑230 (MQ=255) gTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGGATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGGGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGaaa > 1:655817/1‑251 (MQ=255) tACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGaaa < 1:289340/250‑1 (MQ=255) gAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGaaa < 1:820052/246‑1 (MQ=255) gAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAg > 1:876219/1‑251 (MQ=255) aaTCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAg < 1:450266/250‑1 (MQ=255) tCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTa < 1:37304/251‑1 (MQ=255) aCCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAatat < 1:532582/251‑1 (MQ=255) ccGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATAtt < 1:736615/251‑1 (MQ=255) attattTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGAc < 1:262634/251‑1 (MQ=255) attTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGTGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTa < 1:451538/251‑1 (MQ=255) ttGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTAAg < 1:813662/251‑1 (MQ=255) tGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTAAgg < 1:1027/251‑1 (MQ=255) tGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTAAgg < 1:853016/251‑1 (MQ=255) 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CTATATAGGTTTGAGGGCGCGGTACAGAATCAAACCGATCCACTGGGATTATTTGCACCAGTACTTGCGGCACCTTGGATTTTGGAAGGATTAGCCTATGCCGGTACAGCTATGGCGGGCATTCTTATTGGCGTAGGTATAATGGATGCTAAGGAAGAGTATGATAAGGCTCAGGCTCAATCTGCCGCAGAAATTGAAGCGTCTAAATGTGAAAAAGAACGCAAAAGACGTTGTAAGAAGTGGGGGACTGGAACACCAGCTCAGGCTAGAAATATAGTTAATATTAATCGTAGAGGACCTAAGGGGATAAAAAGAATTGATAGACCTGAAGAATCAGTTCCTGGCTCCCAATATCATGCCCATGCTTACAATGATGCAGCACTTAATGTAGATGGAACGGTACATGATAAACATCGTGGAATGCCACCATTCTCTAAAGATGATAAAGATTTTCTATTTTGTTACGGCTGGAAAGGAGTATAAAAGATGCAGAGCTTAACA > 1/286534‑287034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |