| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,284,792 | Δ10 bp | intergenic (+125212/+136136) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1284792 | 1284801 | 10 | 66 [0] | [0] 66 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1284791 | 0 (0.000) | 66 (0.750) | 51/428 | 0.5 | 100% | intergenic (+125211/+136146) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1284802 = | 0 (0.000) | intergenic (+125222/+136135) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
AGGCGCCGGAAACGTGGCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTTGATCGTTCTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAAT > 1/1284548‑1285038 | attaatccgaaaagtggCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTaacagct < 1:580160‑M1/243‑8 (MQ=255) 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aTTTaacagcttgaaaatagcaagtgcggtgaaaatttgaagaatttataacggttttcttttcaagataacgattctataaaaatcggcgaaaaaaggggcacaagatcccttctagcccgccacttttcggattaattcgtccattccggcttcatcatagccctcttcatactgcatatcatccacaaagtctcgcagcaccttgctgtttaacgcggtacaaccatatttttccaatttatttttgg > 1:593525‑M1/1‑4 (MQ=255) aTTTaacagcttgaaaatagcaagtgcggtgaaaatttgaagaatttataacggttttcttttcaagataacgattctataaaaatcggcgaaaaaaggggcacaagatcccttctagcccgccacttttcggattaattcgtccattccggcttcatcatagccctcttcatactgcatatcatccacaaagtctcgcagcaccttgctgtttaacgcggtacaaccatatttttccaatttatttttgg > 1:269542‑M1/1‑4 (MQ=255) aTTTaacagcttgaaaatagcaagtgcggtgaaaatttgaagaatttataacggttttcttttcaagataacgattctataaaaatcggcgaaaaaaggggcacaagatcccttctagcccgccacttttcggattaattcgtccattccggcttcatcatagccctcttcatactgcatatcatccacaaagtctcgcagcaccttgctgtttaacgcggtacaac > 1:368494‑M1/1‑4 (MQ=255) | AGGCGCCGGAAACGTGGCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTTGATCGTTCTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAAT > 1/1284548‑1285038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |