| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,284,792 | Δ10 bp | intergenic (+125212/+136136) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1284792 | 1284801 | 10 | 66 [0] | [0] 66 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1284791 | 0 (0.000) | 66 (0.750) | 51/428 | 0.5 | 100% | intergenic (+125211/+136146) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1284802 = | 0 (0.000) | intergenic (+125222/+136135) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
AGGCGCCGGAAACGTGGCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1284548‑1284791‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGG > 1/1284802‑1285048 attaatccGAAAAGTGGCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCT < 1:580160/243‑1 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1:470325/1‑251 TTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAAC < 1:181625/224‑1 ATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATA > 1:329738/1‑251 TATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGCTTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAA > 1:497767/1‑251 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1:874139/250‑1 GTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCC < 1:735340/250‑1 ATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGAT < 1:666150/231‑1 CAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCG > 1:768851/1‑251 ATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATT < 1:171373/251‑1 TTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAA < 1:263180/145‑1 CCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCT < 1:46221/250‑1 GATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCAT < 1:88677/250‑1 GATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGA > 1:579830/1‑151 ATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATAC < 1:524373/251‑1 GTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTG > 1:118732/1‑250 GTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATC < 1:842372/232‑1 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ATACAGGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAACCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGT < 1:801315/201‑1 GGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTT > 1:164557/1‑251 GGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTC > 1:866293/1‑143 GGATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAAC > 1:223661/1‑54 ATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGG > 1:593525/1‑251 ATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGG > 1:269542/1‑251 ATTTAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGCGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTCATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAAC > 1:368494/1‑227 AGGCGCCGGAAACGTGGCGAAAAATGTCCACCAGATCCGATTCGATCATTTCACCGTCAAAACGTTCGTTATTATAAATGGCAATTGCCAATAAAAACGCCAGACGATCGGTGGGTAAATTCAGCGAAAATTCGCGTTCTTTCGCCCATGAAACCAGTTCGGGGATTGTTTGTGATGTTTCAAGCATTAAGGGATCTCACAATGCATTATTTAAACAAAAAATTGCCTAGATTATACAGGATTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1284548‑1284791‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tAACAGCTTGAAAATAGCAAGTGTGGTGAAAATTTGAAGAATTTATAACGGTTTTCTTTTCAAGATAACGATTCTATAAAAATCGGCGAAAAAAGGGGCACAAGATCCCTTCTAGCCCGCCACTTTTCGGATTAATTCGTCCATTCCGGCTTAATCATAGCCCTCTTCATACTGCATATCATCCACAAAGTCTCGCAGCACCTTGCTGTTTAACGCGGTACAACCATATTTTTCCAATTTATTTTTGG > 1/1284802‑1285048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |