| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 519634 = | 139 (1.580) | 11 (0.220) +TAAACCTAAAATACCCAAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTGAAAAAACTCAAACGAG |
8/246 | 3.2 | 14.4% | intergenic (+22081/‑179709) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1029309 = | 90 (1.020) | intergenic (‑22853/‑5910) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTCGGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAA > 1/519386‑519884 | ttCGGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTtgtg > 1:373809/1‑251 (MQ=37) tCGGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTgtgt < 1:214824/251‑1 (MQ=37) cacTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGt < 1:77898/251‑1 (MQ=35) acTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTg > 1:839347/1‑251 (MQ=35) acTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTg < 1:8585/251‑1 (MQ=35) cTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGa > 1:129708/1‑251 (MQ=35) gcagcaGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGAttt > 1:453789/1‑251 (MQ=35) cagGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGAtttt < 1:585629/248‑1 (MQ=35) ggTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGc > 1:817853/1‑250 (MQ=35) cATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCAt > 1:616162/1‑250 (MQ=35) cATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCAt > 1:294014/1‑250 (MQ=35) aTTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCa > 1:420025/1‑251 (MQ=35) tAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGc < 1:65127/251‑1 (MQ=35) tAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGc < 1:736014/251‑1 (MQ=35) aaGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGcc < 1:495554/251‑1 (MQ=35) gCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCct < 1:313760/249‑1 (MQ=35) tGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCttt > 1:665763/1‑251 (MQ=37) ttCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGa < 1:117625/251‑1 (MQ=37) tttCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAAc < 1:193474/251‑1 (MQ=38) ttCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAAcc < 1:474074/251‑1 (MQ=39) aTGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACaa < 1:439680/251‑1 (MQ=40) cttttcttttTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCGGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATaaa > 1:432814/1‑251 (MQ=255) 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aTTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAg > 1:788207/1‑250 (MQ=255) aTTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGc < 1:887865/251‑1 (MQ=255) ttCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGcc < 1:345179/251‑1 (MQ=255) 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ttGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGAc < 1:407678/251‑1 (MQ=255) gtggtgAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGAcc < 1:878946/210‑1 (MQ=255) ggtgAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGAc > 1:743291/1‑247 (MQ=255) 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gtgtAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCct < 1:116428/233‑1 (MQ=255) gtgtAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACaaa > 1:652353/1‑251 (MQ=255) gtgtAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACaaa > 1:457402/1‑251 (MQ=255) | TTCGGACACTTGCAGCAGGTCATTTAAGGCATGTTTTTCCTTTAACTTTTCGATGACTTTTCTTTTTCTGCCGTCGTTTTTGATTGTCTAATTCCACTAACTTTTTTAGATAATCAATCTCCTCTTTTGCAAGGGCAGGTTCCCGTTTCAGTTTTTTAAAGGCTTGTGGTGAAAAGTCGCTTGTTTCAAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTGTGTAAGGTGATTTTACGCCATCAAGCCTTCTTTCACGAAAGGCTTTAACCACAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTAGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCACTTTTTCACTCTATTTCCCTCTCGTCCGCACCCACAAA > 1/519386‑519884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |