| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 497805 = | NA (NA) | 24 (0.290) +TGTCC |
15/408 | 3.4 | 60.6% | intergenic (+252/‑201538) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 593468 | 16 (0.190) | intergenic (+95915/‑105875) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
ATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGCCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATCC > 1/497562‑498054 | attttattttTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACAcc < 1:269566/251‑1 (MQ=255) ttttAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTCGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTg < 1:15461/251‑1 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCTCACTTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCATCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGTCATTTGAATCCATTCACCCATTGTGTCCATGGCAACGTGCGACACGTAGTCTATTGCTAAACTTTGAATTAATTAAAAACGGTTAGTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCTCCCAAAACCCGGACACCTAAtg > 1:706914/1‑233 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGt < 1:552308/251‑1 (MQ=255) cATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGt > 1:889396/1‑251 (MQ=255) aTAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTc < 1:182541/251‑1 (MQ=255) tGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTActc < 1:393267/251‑1 (MQ=255) cTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATc > 1:497190/1‑248 (MQ=255) cTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAAt < 1:788499/251‑1 (MQ=255) tttGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAAttt > 1:793592/1‑218 (MQ=255) gCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCaa > 1:698424/1‑251 (MQ=255) aTCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTc > 1:208369/1‑211 (MQ=255) gCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAAtt > 1:374803/1‑189 (MQ=255) gTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAAc < 1:72046/236‑1 (MQ=255) 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cGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGa < 1:639863/229‑1 (MQ=255) cGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAg > 1:199425/1‑251 (MQ=255) gATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAgg > 1:783682/1‑251 (MQ=255) aTAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGt < 1:200482/181‑1 (MQ=255) aTAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGa < 1:304500/227‑1 (MQ=255) aTAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATc < 1:711753/243‑1 (MQ=255) gCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTActc > 1:289878/1‑176 (MQ=255) gCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAg < 1:333025/207‑1 (MQ=255) 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tttCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAg < 1:367703/251‑1 (MQ=255) tCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTg < 1:173318/251‑1 (MQ=255) tCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTg < 1:126220/251‑1 (MQ=255) 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cacCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTACGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGa > 1:89271/1‑251 (MQ=37) gatctgcaccccaaaacctggacacGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGAt > 1:342208/25‑251 (MQ=11) ccTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCAtt > 1:210003/1‑160 (MQ=255) ccTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGcc < 1:506908/173‑1 (MQ=255) 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gacacGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGa > 1:629087/5‑230 (MQ=11) cccGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAAt > 1:444670/1‑214 (MQ=14) ccGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATcc < 1:540026/251‑1 (MQ=11) | ATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGCCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACCCGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATCAGATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGT‑AAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATCC > 1/497562‑498054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |