| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 351553 | 63 (0.710) | 29 (0.530) +TACCCAAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTGAAAAAACTCAAACGAG |
20/268 | 1.3 | 37.9% | intergenic (‑6630/+60323) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1029309 = | 90 (1.020) | intergenic (‑22853/‑5910) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
GTGTCTAAACTTTATAAGATTCCTCATTCTCAAGTCATTTATTGGTTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCATAAAATCGCCTTATACTAAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTCAATACTTCAGTTAACTGACCTGTCCAACTTT > 1/351448‑351795 | gtggctaaaCTTCATCAGATTCCTCATTCTCAAGTCATTTATTGATTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGACTTGATGGCGTAAAATCACCTTATACTAAACCTAAAAtacccaaaatgaaaaaaatgcagattgaagtgactgaaacaaccgacttttcaccacaagccttgaaaaaactcaaacgagaagtcataggcgataatttcgccattgaagagatctttaattggtgataaatagagcttgcc < 1:295425‑M1/245‑144 (MQ=255) ggctaAACTTCATCAGATTCCTCATTCTCAAGTCATTTATTGATTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGACTTGATGGCGTAAAATCACCTTATACTAAACCTAAAAtacccaaaatgaaaaaaatgcagattgaagtgactgaaacaaccgacttttcaccacaagccttgaaaaaactcaaacgagaagtcataggcgataatttcgccattgaagagatctttaattggtgataaatagagc < 1:313133‑M1/240‑139 (MQ=255) 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(MQ=255) ataCTAAACCTAAAAtacccaaaatgaaaaaaatgcagattgaagtgactgaaacaaccgacttttcaccacaagccttgaaaaaactcaaacgagaagtcataggcgataatttcgccattgaagagatctttaattggtgataaatagagcttgccttcatcg > 1:656266‑M1/1‑15 (MQ=255) ataCTAAACCTAAAAtacccaaaatgaaaaaaatgcagattgaagtgactgaaacaaccgacttttcaccacaagccttgaaaaaactcaaacgagaagtcataggcgataatttcgccattgaagagatctttaattggtgataaatag > 1:831154‑M1/1‑15 (MQ=255) ataCTAAACCTAAAAtacccaaaatgaaaaaaatgcagattgaagtgactgaaacaaccgacttttcaccacaagccttgaaaaaactcaaacgagaagtcataggcgataatttcgccattgaagagatctttaatt < 1:612519‑M1/138‑124 (MQ=255) acacaaaCCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTa < 1:870337/137‑1 (MQ=255) aaaCCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTCAATACTTCAGTTAACTGACCTGTCCAACtt < 1:410919/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |