| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,404,358 | Δ1,865 bp | coding (1031‑2895/3072 nt) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1404358 | 1406222 | 1865 | 102 [0] | [0] 102 | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1404357 | 0 (0.000) | 102 (1.230) | 65/424 | 0.1 | 100% | coding (1030/3072 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| ? | 1 | 1406223 = | 0 (0.000) | coding (2896/3072 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AGAATGGATGGCGATATTCCGATGAACGCAATTCAGCCCAGAACTGCTGTTTATGGTATAGGTTATGTTCATTCTGATGATAAATTCGGTTTAGATCTGTATATAACTCATGCCGGTGCAAAACAAGCTAAAGATACTTACAATATGTACCACAAAGAGGAAGGAAAAAAAGACAGCTCCATCAAATGGCGTAGTAATTCTTATACAACGATTGATTTACTTGGTTACATTAAGCCAATCAAAAATTTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAGTGCGGTC > 1/1405974‑1406455 | aatttgcatttcaaccaacagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaactccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaa > 1:634867‑M2/250‑250 (MQ=255) gcatttcaaccaacagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTaa > 1:460616‑M2/245‑251 (MQ=255) caacagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGt < 1:122436‑M2/17‑1 (MQ=255) acagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtat > 1:325090‑M2/233‑251 (MQ=255) acagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtat > 1:511678‑M2/233‑251 (MQ=255) acagataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtat > 1:200928‑M2/233‑251 (MQ=255) gataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatata > 1:513213‑M2/230‑251 (MQ=255) gataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcctacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatata > 1:865925‑M2/230‑251 (MQ=255) ataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatata < 1:506766‑M2/22‑1 (MQ=255) ataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat < 1:164556‑M2/21‑1 (MQ=255) ataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat < 1:23075‑M2/21‑1 (MQ=255) ataaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtat < 1:641319‑M2/19‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:203032‑M2/24‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:388547‑M2/24‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:536958‑M2/24‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:2207‑M2/24‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:626171‑M2/24‑1 (MQ=255) taaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:642290‑M2/24‑1 (MQ=255) aaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtc < 1:606306‑M2/25‑1 (MQ=255) aaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtc < 1:63799‑M2/25‑1 (MQ=255) aaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtc < 1:722899‑M2/25‑1 (MQ=255) aaccaccgcttctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt > 1:239907‑M2/227‑250 (MQ=255) tctccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaAc > 1:110216‑M2/217‑218 (MQ=255) ccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtct > 1:583742‑M2/214‑239 (MQ=255) ccgttatggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt > 1:859456‑M2/214‑237 (MQ=255) tggcagatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:71597‑M2/24‑1 (MQ=255) gatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgatgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat < 1:15676‑M2/21‑1 (MQ=255) gatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTAc > 1:865982‑M2/203‑249 (MQ=255) gatttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTAc > 1:292181‑M2/203‑249 (MQ=255) atttatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat < 1:387102‑M2/21‑1 (MQ=255) tatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGa > 1:473071‑M2/199‑251 (MQ=255) tatataagcaaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGa > 1:652361‑M2/199‑251 (MQ=255) caaacctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCg < 1:700791‑M2/60‑1 (MQ=255) cctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGc > 1:469907‑M2/187‑197 (MQ=255) cctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt < 1:24942‑M2/24‑1 (MQ=255) cctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGAt > 1:839930‑M2/187‑250 (MQ=255) cctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGAt > 1:406694‑M2/187‑250 (MQ=255) cctctaaaggacatgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGAt > 1:741598‑M2/187‑250 (MQ=255) tgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtc < 1:119796‑M2/25‑1 (MQ=255) tgatttttcttacacattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTAc < 1:387384‑M2/47‑1 (MQ=255) acattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATc < 1:821287‑M2/91‑1 (MQ=255) cattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTggg > 1:544219‑M2/160‑211 (MQ=255) cattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGt > 1:752812‑M2/160‑246 (MQ=255) cattaaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAAt > 1:608210‑M2/160‑249 (MQ=255) taaagccaaatactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGAt < 1:679326‑M2/95‑1 (MQ=255) tactcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgcttcgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAag < 1:281268‑M2/105‑1 (MQ=255) actcaatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtc < 1:638761‑M2/25‑1 (MQ=255) caatttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagaagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtct > 1:121824‑M2/143‑168 (MQ=255) atttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAAc < 1:413570‑M2/33‑1 (MQ=255) atttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTAc < 1:616839‑M2/47‑1 (MQ=255) atttagaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGa < 1:813679‑M2/94‑1 (MQ=255) gaacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTggg > 1:583430‑M2/136‑251 (MQ=255) aacctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGt < 1:588517‑M2/117‑1 (MQ=255) acctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat > 1:673916‑M2/134‑154 (MQ=255) cctatgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAg > 1:355260‑M2/133‑167 (MQ=255) atgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAatat > 1:512331‑M2/130‑171 (MQ=255) tgacgaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAAc < 1:619478‑M2/123‑1 (MQ=255) gaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGt < 1:734785‑M2/87‑1 (MQ=255) gaggaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCg > 1:361574‑M2/125‑249 (MQ=255) gaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGtatat < 1:30097‑M2/21‑1 (MQ=255) gaagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTggg > 1:439325‑M2/122‑173 (MQ=255) aagagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCaa < 1:851098‑M2/131‑1 (MQ=255) gagttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGAt < 1:299246‑M2/112‑1 (MQ=255) ttacgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGc < 1:19291‑M2/134‑1 (MQ=255) cgtcacaccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAt > 1:817694‑M2/113‑136 (MQ=255) ccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTaa < 1:822749‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTaa > 1:591458‑M2/106‑251 (MQ=255) caatgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAAt < 1:83618‑M2/147‑1 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATc < 1:595602‑M2/91‑1 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAagag > 1:567860‑M2/102‑208 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCAc < 1:355231‑M2/136‑1 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCAc < 1:702356‑M2/136‑1 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATtat > 1:155583‑M2/102‑251 (MQ=255) tgataaagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATtat > 1:168411‑M2/102‑251 (MQ=255) aagtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAtct > 1:28904‑M2/97‑122 (MQ=255) agtagaacgtaaaaatttcgcctttacctatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGAt > 1:789426‑M2/96‑190 (MQ=255) tatgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCaa > 1:422290‑M2/68‑198 (MQ=255) atgaaaacttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAg < 1:702216‑M2/152‑1 (MQ=255) cttcacaacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTa < 1:261440‑M2/88‑1 (MQ=255) caacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAAcc < 1:127697‑M2/179‑1 (MQ=255) caacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGc > 1:254668‑M2/55‑250 (MQ=255) caacaacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGc > 1:19769‑M2/55‑250 (MQ=255) caacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTg < 1:437142‑M2/97‑1 (MQ=255) caacaccgctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATtat > 1:496572‑M2/52‑201 (MQ=255) gctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGAAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAAcc < 1:793050‑M2/124‑1 (MQ=255) ctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGAt < 1:467617‑M2/112‑1 (MQ=255) ctttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTtctc > 1:856385‑M2/44‑250 (MQ=255) ttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGAt < 1:452018‑M2/64‑1 (MQ=255) ttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATc < 1:61988‑M2/91‑1 (MQ=255) ttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGc > 1:256642‑M2/42‑175 (MQ=255) ttgggatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCtt < 1:824983‑M2/210‑1 (MQ=255) gatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTtttc < 1:669984‑M2/213‑1 (MQ=255) gatacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATAGTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTtttc < 1:426834‑M2/213‑1 (MQ=255) atacattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTtttctt < 1:429020‑M2/215‑1 (MQ=255) acattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGAt < 1:22421‑M2/54‑1 (MQ=255) cattgaaaatcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGAc < 1:169091‑M2/154‑1 (MQ=255) atcacctattcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAg < 1:519314‑M2/226‑1 (MQ=255) attcccaacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGctttaaagctgtctt > 1:769275‑M2/19‑244 (MQ=255) caacaaaaaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAAcc < 1:205081‑M2/179‑1 (MQ=255) aaattaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGAc > 1:188354‑M2/7‑160 (MQ=255) | AGAATGGATGGCGATATTCCGATGAACGCAATTCAGCCCAGAACTGCTGTTTATGGTATAGGTTATGTTCATTCTGATGATAAATTCGGTTTAGATCTGTATATAACTCATGCCGGTGCAAAACAAGCTAAAGATACTTACAATATGTACCACAAAGAGGAAGGAAAAAAAGACAGCTCCATCAAATGGCGTAGTAATTCTTATACAACGATTGATTTACTTGGTTACATTAAGCCAATCAAAAATTTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAGTGCGGTC > 1/1405974‑1406455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |