| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | 1 | 1,404,358 | Δ1,865 bp | coding (1031‑2895/3072 nt) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | 1406223 = | 0 (0.000) | coding (2896/3072 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AATTTGCATTTCAACCAACAGATAACCACCGCTTCTCCGTTATGGCAGATTTATATAAGCAAACCTCTAAAGGACATGATTTTTCTTACACATTAAAGCCAAATACTCAATTTAGAACCTATGACGAGGAAGAGTTACGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1404109‑1404357‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAGTGCGGTC > 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AAGAGTTACGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAA < 1:851098/251‑1 GAGTTACGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGAT < 1:299246/230‑1 TTACGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGC < 1:19291/249‑1 CGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAAT > 1:817694/1‑136 CCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAA < 1:822749/251‑1 CCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAA > 1:591458/1‑251 CAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAAT < 1:83618/251‑1 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TGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCAC < 1:702356/237‑1 TGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAG > 1:567860/1‑208 TGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATC < 1:595602/192‑1 AAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCT > 1:28904/1‑122 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CAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGC > 1:254668/1‑250 CAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGC > 1:19769/1‑250 CAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACC < 1:127697/233‑1 CAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTAT > 1:496572/1‑201 CAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTG < 1:437142/148‑1 GCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGAAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACC < 1:793050/168‑1 CTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTC > 1:856385/1‑250 CTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGAT < 1:467617/155‑1 TTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTT < 1:824983/251‑1 TTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGC > 1:256642/1‑175 TTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATC < 1:61988/132‑1 TTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGAT < 1:452018/105‑1 GATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTC < 1:669984/250‑1 GATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATAGTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTC < 1:426834/250‑1 ATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTT < 1:429020/251‑1 ACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGAT < 1:22421/88‑1 CATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGAC < 1:169091/187‑1 ATCACCTATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAG < 1:519314/251‑1 ATTCCCAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAGctgtctt > 1:769275/1‑244 CAACAAAAAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACC < 1:205081/192‑1 AAATTAACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGAC > 1:188354/1‑160 AATTTGCATTTCAACCAACAGATAACCACCGCTTCTCCGTTATGGCAGATTTATATAAGCAAACCTCTAAAGGACATGATTTTTCTTACACATTAAAGCCAAATACTCAATTTAGAACCTATGACGAGGAAGAGTTACGTCACACCAATGATAAAGTAGAACGTAAAAATTTCGCCTTTACCTATGAAAACTTCACAACAACACCGCTTTGGGATACATTGAAAATCACCTATTCCCAACAAAAAATTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1404109‑1404357‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaACTTTAAGAGCCGGAGTATATAATCTCACAAACAGAAAATATATTACTTGGGATTCTGCGAGATCAATCCGCCCATTTGGTACAAGTAATCTGATTGACCAAAAGAGTGGATTGGGTATCAACCGCTTCAACGCACCGGGTCGTAATTATAGACTTTCAATGCAACTTGAATTCTAACCAAACAAAAAGGAGAAGCCCTCGCTTCTCCTTTTCTTTCGCTTTAAAGTGCGGTC > 1/1406223‑1406455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |