| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 155,724 | (GCTTCTG)5→2 | intergenic (‑138/+141) | unknown ← / ← unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 155724 | 155744 | 21 | 51 [0] | [0] 51 | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 155723 | 0 (0.000) | 47 (0.600) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (‑137/+162) | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| ? | 1 | 155745 = | 0 (0.000) | intergenic (‑159/+140) | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family | |||||
AGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTT > 1/155503‑155991 | gtcaagataaaggggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAAtt > 1:260542‑M2/243‑251 (MQ=255)gtcaagataaaggggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAAt < 1:89832‑M2/8‑1 (MQ=255)gtcaagataaaggggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAAt < 1:367683‑M2/8‑1 (MQ=255) agataaaggggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGt > 1:844427‑M2/239‑250 (MQ=255) gataatggggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTc > 1:354594‑M2/238‑250 (MQ=255) ggattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTaa < 1:777525‑M2/21‑1 (MQ=255) gattttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAAt > 1:249690‑M2/229‑236 (MQ=255) attttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg < 1:93034‑M2/23‑1 (MQ=255) attttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg < 1:768317‑M2/23‑1 (MQ=255) attttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg < 1:163669‑M2/23‑1 (MQ=255) attttcaggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg < 1:722429‑M2/23‑1 (MQ=255) ggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg > 1:765675‑M2/221‑243 (MQ=255) ggattagaaagctcgacacggattttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGtaaa > 1:679686‑M2/221‑251 (MQ=255) ttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAg < 1:318557‑M2/55‑1 (MQ=255) ttgtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAg < 1:340561‑M2/55‑1 (MQ=255) gtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATAcc < 1:889077‑M2/45‑1 (MQ=255) gtcttgctgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGa > 1:647163‑M2/195‑251 (MQ=255) tgtgcggtgaagctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGc < 1:514080‑M2/64‑1 (MQ=255) ctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAg < 1:215752‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAg < 1:71908‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAg < 1:152342‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGa < 1:341639‑M2/76‑1 (MQ=255) gtcggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAg > 1:630285‑M2/174‑228 (MQ=255) cggagatgtattttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAg < 1:124866‑M2/80‑1 (MQ=255) attttaagaagattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAg > 1:73265‑M2/163‑185 (MQ=255) gattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAAtt > 1:693288‑M2/153‑251 (MQ=255) gccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATAttt > 1:593252‑M2/147‑251 (MQ=255) ccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATAttt < 1:831175‑M2/105‑1 (MQ=255) gcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTcc > 1:132389‑M2/142‑155 (MQ=255) gcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAagcat < 1:734232‑M2/83‑3 (MQ=255) cacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACtt > 1:372546‑M2/141‑251 (MQ=255) caatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAAt < 1:73171‑M2/8‑1 (MQ=255) 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gtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATg > 1:770658‑M2/129‑251 (MQ=255) ctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATgagag < 1:80567‑M2/88‑1 (MQ=255) gcggagacggtcgacggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTtcactc < 1:271097‑M2/146‑1 (MQ=255) 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AGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTT > 1/155503‑155991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |