| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 155,724 | (GCTTCTG)5→2 | intergenic (‑138/+141) | unknown ← / ← unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 155724 | 155744 | 21 | 51 [0] | [0] 51 | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 155723 | 0 (0.000) | 47 (0.600) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (‑137/+162) | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| ? | 1 | 155745 = | 0 (0.000) | intergenic (‑159/+140) | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family | |||||
GTCAAGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCA > 1/155482‑155970 | gTCAAGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaatt > 1:260542‑M1/1‑242 (MQ=255)gTCAAGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaat < 1:367683‑M1/250‑9 (MQ=255)gTCAAGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaat < 1:89832‑M1/250‑9 (MQ=255) aGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaatttgt > 1:844427‑M1/1‑238 (MQ=255) 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(MQ=255) caATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaat < 1:73171‑M1/146‑9 (MQ=255) gtgtTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaatttgtcctttgtaaagtgagtaaataaaaaaatatacctattttatag < 1:371006‑M1/189‑56 (MQ=255) gtgtTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaatttgtcctttgtaa > 1:546154‑M1/1‑134 (MQ=255) gtgtTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGcataaaatttgtcctttgtaa < 1:75261‑M1/155‑22 (MQ=255) 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GTCAAGATAAAGGGGATTTTCAGGATTAGAAAGCTCGACACGGATTTTGTCTTGCTGTGCGGTGAAGCTGTCGGAGATGTATTTTAAGAAGATTAAGCCAAGCACAATGTGTTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCA > 1/155482‑155970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |