| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 4 | 25,236 | (TTA)2→1 | coding (321‑323/798 nt) | unknown ← | Inner membrane protein YpjD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 4 | 25236 | 25238 | 3 | 83 [0] | [0] 83 | unknown | Inner membrane protein YpjD |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 4 | = 25235 | 0 (0.000) | 82 (0.840) | 55/422 | 0.6 | 100% | coding (324/798 nt) | unknown | Inner membrane protein YpjD |
| ? | 4 | 25239 = | 0 (0.000) | coding (320/798 nt) | unknown | Inner membrane protein YpjD | |||||
ATTTCACCGCTTACCAATAAACGGAAAAAATGGCGTTCCACCGTCATCAATGGCGGCACCATCGGCGAAAAGTGCATTTTTTTAGCTTTTAAGCGACGGTCAATCCAGCCCAGTTGAATGGCGTATAGCGTGGCGATGCAGTATACCGCGTAGGCAAAAATGGACAAGCCGATATGAAATAACATGGAACCGTTTTGATTCAACAGCTGAATAATATGGCTTGGAATAAAAGTGGCACAAACCAGATTATTAACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACATGGCAAATAATGGCGAAAAGTGCGGTCAGAAAAAATGGCGTTTTTTTAGGTTGGGTTTGCCCGCCATTGACCTG > 4/24987‑25483 | tttccaccgCTTACCAAAAAACGGAAAAAAGGGCGTTCCACCGTCATCAATGGCGGCACCATCGGCGAAAAGTGCATTTTTTTAGCTTTTAAGCGACGGTCAACCCAGCCCAGTTGAATGGCGTATAGCGTGGCGATGCAGCATCCCGCGTAGGAAAAAAGGGACAAGCCGATATGAAATAACATGGAACCGTTTTGATTCAACAGCTGAATAATATGGCTTGGAATAAAAGTGGCACAAACCAGATTAac < 1:894282‑M1/247‑3 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |