| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 4 | 25,236 | (TTA)2→1 | coding (321‑323/798 nt) | unknown ← | Inner membrane protein YpjD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 4 | 25236 | 25238 | 3 | 83 [0] | [0] 83 | unknown | Inner membrane protein YpjD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 4 | = 25235 | 0 (0.000) | 82 (0.840) | 55/422 | 0.6 | 100% | coding (324/798 nt) | unknown | Inner membrane protein YpjD |
| ? | 4 | 25239 = | 0 (0.000) | coding (320/798 nt) | unknown | Inner membrane protein YpjD | |||||
TCACCGCTTACCAATAAACGGAAAAAATGGCGTTCCACCGTCATCAATGGCGGCACCATCGGCGAAAAGTGCATTTTTTTAGCTTTTAAGCGACGGTCAATCCAGCCCAGTTGAATGGCGTATAGCGTGGCGATGCAGTATACCGCGTAGGCAAAAATGGACAAGCCGATATGAAATAACATGGAACCGTTTTGATTCAACAGCTGAATAATATGGCTTGGAATAAAAGTGGCACAAACCAGATTATTAACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACATGGCAAATAATGGCGAAAAGTGCGGTCAGAAAAAATGGCGTTTTTTTAGGTTGGGTTTGCCCGCCATTGACCTGCGA > 4/24990‑25486 | tttccaccgcttaccaaaaaacggaaaaaagggcgttccaccgtcatcaatggcggcaccatcggcgaaaagtgcatttttttagcttttaagcgacggtcaacccagcccagttgaatggcgtatagcgtggcgatgcagcatcccgcgtaggaaaaaagggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaAc < 1:894282‑M2/2‑1 (MQ=255)atttcaccgcttaccaataaacggaaaaaatggcgttccaccgtcatcaatggcggcaccatcggcgaaaagtgcatttttttagcttttaagcgacggtcaatccagcccagttgaatggcgtatagcgtggcgatgcagcataccgcgtaggaaaaaagggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaAc < 1:884261‑M2/2‑1 (MQ=255)attccaccgcttaccaataaacggaaaaaatggcgttccaccgtcatcaatggcggcaccatcggcgaaaagtgcatttttttagctttaaagcgacggtcaacccagcccagttgaatggcgtatagcgtggcgatgcagcatcccgggaaggaaaaaatggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaAc < 1:612431‑M2/2‑1 (MQ=255) ccaataaacggaaaaaatggcgttccaccgtcatcaatggcggcaccatcggcgaaaagtgcatttttttagcttttaagcgacggtcaatccagcccagttgaatggcgtatagcgtggcgatgcagcataccgcgtaggcaaaaatggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCaa > 1:314094‑M2/237‑251 (MQ=255) 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1:128468‑M2/143‑251 (MQ=255) gcccagttgaatggcgtatagcgtggcgatgcagcataccgcgtaggcaaaaatggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACtt > 1:87712‑M2/143‑251 (MQ=255) atggcgtatagcgtggcgatgcagcatcccgcgtaggcaaaaatggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGt < 1:824642‑M2/119‑1 (MQ=255) ggcgtatggcgtggcgatgcagcataccgcgtaggaaaaaagggacaagccgatatgaaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAacac < 1:147426‑M2/32‑1 (MQ=255) 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1:12720‑M2/77‑162 (MQ=255) aaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGaaa > 1:784169‑M2/74‑83 (MQ=255) aaataacatggaaccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACATGGCaaa > 1:503575‑M2/74‑251 (MQ=255) ccgttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGa < 1:406‑M2/101‑1 (MQ=255) gttttgattcaacagctgaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAAc > 1:505951‑M2/59‑228 (MQ=255) 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gaataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAgcaacggc < 1:824124‑M2/156‑1 (MQ=255) ataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGc > 1:648723‑M2/40‑130 (MQ=255) ataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATc > 1:69479‑M2/40‑182 (MQ=255) ataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACa > 1:448631‑M2/40‑210 (MQ=255) ataatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACATGGCAAATAATGGCGAAAAGTGCGGTCAGAAAAAATGGCGt > 1:487443‑M2/40‑251 (MQ=255) taatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAAc > 1:785438‑M2/39‑208 (MQ=255) taatatggcttggaataaaagtggcacaaaccagattaACCATGGAAAAGCAATACACAATTGGCAACACAAACCACATGCTGTTCACCCGCAACATGGCAAGTGTGGCTAATGAGGCGATAATCACGCTCATCAATGACGCCACTTCCATCAGGGTAAAGGCTTGTCCGTTTGCCAGATCATTGAGCAACGGCAACGTGGTGAAAACATGGCAAATAATGGCGAAAAGTGCGGTCAGAAAAAATGGCGtt > 1:726340‑M2/39‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |