| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 2 | 155,102 | Δ9,084 bp | unknown–[unknown] | 17 genes unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, unknown, [unknown] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 2 | 155102 | 164185 | 9084 | 79 [0] | [0] 79 | unknown–[unknown] | unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,unknown,[unknown] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 2 | = 155101 | 0 (0.000) | 77 (0.710) | 50/426 | 0.8 | 100% | intergenic (‑464/+603) | unknown/unknown | Deoxyribose‑phosphate aldolase (EC 4.1.2.4)/hypothetical protein |
| ? | 2 | 164186 = | 0 (0.000) | coding (133/1245 nt) | unknown | Integrase | |||||
AAAAGTTTTTTTTGGTTTTGCGATACTCAAGCCACGCCCACGCCACTGCTTCATAGGTATTATTCAGCTCATTTTGCTTAGCTTGTTCTTGCTGTTGGCGATAGATTGCCGGATCGATATTCTGCGCAAGTAAAGATAAATATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTAT > 2/163940‑164435 | aaaattatcaagccggtcaccgagcaggatttcggtatatgagcggtagctaaatttcatcagatttctcgttctcaagtcatttattggaaaagcctttcgtgaaagagggcttgatggcgtaaaatcgccttatacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCg > 1:460453‑M2/247‑250 (MQ=255) ttatcaagccggtcaccgagcaggatttcggtatatgagcggtagctaaatttcatcagatttctcgttctcaagtcatttattggaaaagcctttcgtgaaagagggcttgatggcgtaaaatcgccttatacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATa > 1:99925‑M2/243‑251 (MQ=255) ttatcaagccggtcaccgagcaggatttcggtatatgagcggtagctaaatttcatcagatttctcgttctcaagtcatttattggaaaagcctttcgtgaaagagggcttgatggcgtaaaatcgccttatacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATa > 1:836864‑M2/243‑251 (MQ=255) ttatcaagccggtcaccgagcaggatttcggtatatgagcggtagctaaatttcatcagatttctcgttctcaagtcatttattggaaaagcctttcgtgaaagagggcttgatggcgtaaaatcgccttatacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATa > 1:462969‑M2/243‑251 (MQ=255) 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1:240571‑M2/117‑129 (MQ=255) ccttatacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCgg > 1:540832‑M2/117‑231 (MQ=255) atacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGccatatcg > 1:364045‑M2/113‑247 (MQ=255) atacaaacctaaaacctccaaaattctgaaaccccaaatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCatat > 1:49535‑M2/113‑247 (MQ=255) 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aatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCgg > 1:378310‑M2/77‑191 (MQ=255) aatgaaaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCgg > 1:348598‑M2/77‑191 (MQ=255) aaagaacgcagattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATaa > 1:776495‑M2/72‑81 (MQ=255) gattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAAcc > 1:732923‑M2/62‑93 (MQ=255) gattgaagtggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGAt > 1:437347‑M2/62‑120 (MQ=255) 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1:315874‑M2/55‑212 (MQ=255) ggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTc > 1:462182‑M2/53‑226 (MQ=255) ggctgaaacaagtgacttttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTaaaaa > 1:471297‑M2/53‑251 (MQ=255) ttttcccccacaagctttaaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCgg < 1:716238‑M2/115‑1 (MQ=255) 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tttaaaaaactaaacgggaaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACa < 1:333238‑M2/218‑1 (MQ=255) aaaactaaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCCTTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGc < 1:615660‑M2/235‑1 (MQ=255) aagcaaaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAgagttgaaaattattc < 1:256472‑M2/164‑7 (MQ=255) aaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCggc > 1:10832‑M2/16‑98 (MQ=255) aactaaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATAGGGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCt < 1:185195‑M2/237‑1 (MQ=255) ctgaacggggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCggcttggc < 1:376129‑M2/88‑1 (MQ=255) aACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTAt < 1:616876‑M2/250‑1 (MQ=255) aACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTAAAACATGAGTAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTAt < 1:883016‑M2/250‑1 (MQ=255) | AAAAGTTTTTTTTGGTTTTGCGATACTCAAGCCACGCCCACGCCACTGCTTCATAGGTATTATTCAGCTCATTTTGCTTAGCTTGTTCTTGCTGTTGGCGATAGATTGCCGGATCGATATTCTGCGCAAGTAAAGATAAATATTCCTCTCTAATTGCTCTTGCCTGCTGTAAGGAAATATCAGGGTATTTGCCAACGCCAATTAACGCCCTTTTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTAT > 2/163940‑164435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |