| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 90181 = | 92 (1.090) | 60 (0.810) | 41/350 | 0.4 | 61.6% | intergenic (+92/‑206) | unknown/unknown | DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7)/hypothetical protein |
| ? | 3 | 20776 = | 0 (0.000) | intergenic (‑3/+247) | unknown/unknown | hypothetical protein/Mannose‑6‑phosphate isomerase | |||||
GGTGAAAAGTCGGTTGTTTCAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTAGTATAAGGCGATTTTATGCCATCAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTAACCAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTTATAAAGTTTAGACACCTTATAAATACTAAAATCCTGTTCGGTGATCGGTTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAGGACATAACCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAATATCTGCTTTCCGGCAATACGCTTCTGGCTTCGCTGTGTTCTTTGTAGTGCATTTCTACTACGCCGTCCATTACGGCAAATATTTCTTCGCCGTCATTGGTGTGTCA > 3/20526‑21025 | tttaaaggcttgtggtgaaaagtcggttgtttcagccacttcaatctgcgtttttttcattttgggtttcagaattttggaggttttaggtttgtgtaaggtgattttacgccatcaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataac < 1:685315‑M2/1‑1 (MQ=255) 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1:548162‑M2/163‑250 (MQ=255) gtgtaaggtgattttacgccatcaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCcgcg > 1:181178‑M2/158‑249 (MQ=255) tttacgccatcaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCggg < 1:68224‑M2/106‑1 (MQ=255) tacgccatcaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTg < 1:128190‑M2/108‑1 (MQ=255) 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1:819382‑M2/128‑251 (MQ=255) tttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTcgatgc < 1:521862‑M2/125‑1 (MQ=255) aaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCgatgccgatgcc < 1:185248‑M2/132‑1 (MQ=255) ataaatgacttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataac < 1:574809‑M2/1‑1 (MQ=255) cttgagaacgagaaatttagccacctctcatataccgaaatcctgctcggtgactagcttgataatttttaaacgaaattgataagagtaggacataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAat > 1:339678‑M2/99‑242 (MQ=255) 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ataaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAATATCTGCTTTCCGGCAATACGCTTCTGGCTTCGCTGTGTTCTTTGTAGTGCATTTCTACTACGCCGTCCATTACGGCAAATATTTCTTCGCCGTCATTGgtgtg < 1:271654‑M2/247‑1 (MQ=255) taaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAATATCTGCTTTCCGGCAATACGCTTCTGGCTTCGCTGTGTTCTTTGTAGTGCATTTCTACTACGc > 1:562261‑M2/4‑210 (MQ=255) aaCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACActgc > 1:410408‑M2/3‑64 (MQ=255) aCCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAATATCTGCTTTCCGGCAATACGCTTCTGGCTTCGCTGTGTTCTTTGTAGTGCATTTCTACTACGCCGTCCATTACGGCAAATATTTCTTCGCCGTCATTGGTGTGTCa > 1:322274‑M2/2‑251 (MQ=255) | GGTGAAAAGTCGGTTGTTTCAGCCACTTCAATCTGCGTTTTTTTCATTTTGGGTTTCAGAATTTTGGAGGTTTTAGGTTTAGTATAAGGCGATTTTATGCCATCAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTAACCAATAAATGACTTGAGAATGAGGAATCTTATAAAGTTTAGACACCTTATAAATACTAAAATCCTGTTCGGTGATCGGTTTGATAATTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAGGACATAACCAGCACCTTATAATTAGGTGTTCAGGTTTTGGGTGCAGATCACTTTTTTATTAAACACTGCTGCCCGTTTTTTCAACCACCAAAATCCGCGCTTCGCCCTGCGGGTGGACGACGTGTTCGATGCCGATGCCGGCGTAAAAAATATCTGCTTTCCGGCAATACGCTTCTGGCTTCGCTGTGTTCTTTGTAGTGCATTTCTACTACGCCGTCCATTACGGCAAATATTTCTTCGCCGTCATTGGTGTGTCA > 3/20526‑21025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |