| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 90181 = | 92 (1.090) | 60 (0.810) | 41/350 | 0.4 | 61.6% | intergenic (+92/‑206) | unknown/unknown | DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7)/hypothetical protein |
| ? | 3 | 20776 = | 0 (0.000) | intergenic (‑3/+247) | unknown/unknown | hypothetical protein/Mannose‑6‑phosphate isomerase | |||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
AGCGGCAATTCGCTGCCGGTGCATATTTACTACCAAAGCCCGCAGGGCAGAGCGCTGGTTAAAATGGGCGTGCAATGGTCGGTCAACCCGACGGACGAACTGCTCACCGAACTGGCGGCACTGTTCGGTGAAAGTGCGGTGGAATTGGAGTTTGAATAGATAGGAAAAAGTGCGGTTAAAAAATGATTGTTTTTTCAACTGCACTTTGATCTACACCCCAAAAAAATCGGCATATAATTTAAGTTGCAGATTATGTCCTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAGCTAGTCACCGAGCAGGATTTCGGTATATGAGAGGTGGCTAAATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCGTAAAATCACCTTACACAAACCTAAAATCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTTGAAACAAGCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAA > 1/89931‑90431 | tgacacaccaatgacggcgaagaaatatttgccgtaatggacggcgtagtagaaatgcactacaaagaacacagcgaagccagaagcgtattgccggaaagcagatattttttacgccggcatcggcatcgaacacgtcgtccacccgcagggcgaagcgcggattttggtggttgaaaaaacgggcagcagtgtttaataaaaaagtgatctgcacccaaaacctgaacacctaattataaggtgctggt > 1:322274‑M1/251‑251 (MQ=255) cGGCAATTCGCTGCCGGTGCATATTTACTACCAAAGCCCGCAGGGCAGAGCGCTGGTTAAAATGGGCGTGCAATGGTCGGTCAACCCGACGGACGAACTGCTCACCGAACTGGCGGCACTGTTCGGTGAAAGTGCGGTGGAATTGGAGTTTGAATAGATAGGAAAAAGTGCGGTTAAAAAATGATTGTTTTTTCAACTGCACTTTGATCTACACCCCAAAAAAATCGGCATATAATTTAAGTTGCAGAt < 1:354708/249‑1 (MQ=255) accaatgacggcgaagaaatatttgccgtaatggacggcgtagtagaaatgcactacaaagaacacagcgaagccagaagcgtattgccggaaagcagatattttttacgccggcatccgcatcgaacacgtcgtccacccgcagggcgacgcgcggattttggtggttgaaaaaacgggcagcagtgtttaataaaaaagcgatctgcacccaaaacctgaacacctaattataaggtgctggTTATGt < 1:711002‑M1/6‑1 (MQ=255) cGCTGCCGGTGCATATTTACTACCAAAGCCCGCAGGGCAGAGCGCTGGTTAAAATGGGCGTGCAATGGTCGGTCAACCCGACGGACGAACTGCTCACCGAACTGGCGGCACTGTTCGGTGAAAGTGCGGTGGAATTGGAGTTTGAATAGATAGGAAAAAGTGCGGTTAAAAAATGATTGTTTTTTCAACTGCACTTTGATCTACACCCCAAAAAAATCGGCATATAATTTAAGTTGCAGATTATGTCCTAc < 1:594129/251‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGCATATTTACTACCAAAGCCCGCAGGGCAGAGCGCTGGTTAAAATGGGCGTGCAATGGTCGGTCAACCCGACGGACGAACTGCTCACCGAACTGGCGGCACTGTTCGGTGAAAGTGCGGTGGAATTGGAGTTTGAATAGATAGGAAAAAGTGCGGTTAAAAAATGATTGTTTTTTCAACTGCACTTTGATCTACACCCCAAAAAAATCGGCATATAATTTAAGTTGCAGATTATGTCCTActc < 1:260243/251‑1 (MQ=255) acggcgaagaaatatttgccgtaatggacggcgtagtagaaatgcactacaaagaacacagcgaagccagaagcgtattgccggaaagcagatattttttacgccggcatcggcatcgaacacgtcgtccacccgcagggcgaagcgcggattttggtggttgaaaaaacgggcagcagtgtttaataaaaaagtgatctgcacccaaaacctgaacacctaattataaggtgctggTTATGTCCTActc > 1:849204‑M1/238‑250 (MQ=255) acggcgaagaaatatttgccgtaatggacggcgtagtagaaatgcactacaaagaacacagcgaagccagaagcgtattgccggaaagcagatattttttacgccggcatcggcatcgaacacgtcgtccacccgcagggcgaagcgcggattttggtggttgaaaaaacgggcagcagtgtttaataaaaaagtgatctgcacccaaaacctgaacacctaattataaggtgctggTTATGTCCTActc > 1:835899‑M1/238‑250 (MQ=255) 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gATTATGTCCTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAGCTAGTCACCGAGCAGGATTTCGGTATATGAGAGGTGGCTAAATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCGTAAAATCACCTTACACAAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTTGAAACAAGCGACTTTTCACCACAAGACTTTa > 1:310970/1‑251 (MQ=255) gTTATGTCCTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAGCTAGTCACCGAGCAGGATTTCGGTATATGAGAGGTGGCTAAATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTAt < 1:574809‑M1/106‑1 (MQ=255) | AGCGGCAATTCGCTGCCGGTGCATATTTACTACCAAAGCCCGCAGGGCAGAGCGCTGGTTAAAATGGGCGTGCAATGGTCGGTCAACCCGACGGACGAACTGCTCACCGAACTGGCGGCACTGTTCGGTGAAAGTGCGGTGGAATTGGAGTTTGAATAGATAGGAAAAAGTGCGGTTAAAAAATGATTGTTTTTTCAACTGCACTTTGATCTACACCCCAAAAAAATCGGCATATAATTTAAGTTGCAGATTATGTCCTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAGCTAGTCACCGAGCAGGATTTCGGTATATGAGAGGTGGCTAAATTTCTCGTTCTCAAGTCATTTATTGGAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCGTAAAATCACCTTACACAAACCTAAAATCTCCAAAATTCTGAAACCCAAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTTGAAACAAGCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAA > 1/89931‑90431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |