| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 28 = | NA (NA) | 120 (1.390) +ATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAA |
72/370 | 0.0 | 100% | intergenic (–/‑114) | –/unknown | –/Transposase, IS200 family |
| ? | 6 | = 31282 | 0 (0.000) | intergenic (+44/–) | unknown/– | SSU ribosomal protein S17p (S11e)/– | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
AAATCTTTCGTTGTTGCTATTGAACGCAAGGTTAAACACCCACTTTATGGCAAGTTTATCCGTCGCACAACCAAACTACATGTGCACGATGAAAACAACGAAGCTAAATTAGGTGATTTAGTAGAAGTTCGCGAATGTCGTCCAATTTCTAAAACTAAATCATGGACTTTAGTTCGTGTAGTTGAGAAAGCAGTAATTGCTTAATTAACGATAAATAGAAGCCGATGATTTTATCATTGGCTTTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 6/31035‑31282 | aaaTCTTTCGTTGTTGCTATTGAACGCAAGGTTAAACACCCACTTTATGGCAAGTTTATCCGTCGCACAACCAAACTACATGTGCACGATGAAAACAACGAAGCTAAATTAGGTGATTTAGTAGAAGTTCGCGAATGTCGTCCAATTTCTAAAACTAAATCATGGACTTTAGTTCGTGTAGTTGAGAAAGCAGTAATTGCTTAATTAACGATAAATAGAAGCCGATGATTTTATCATTGGCTTTTTTAttt > 1:430804‑M2/1‑248 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |