| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 28 = | NA (NA) | 120 (1.390) +ATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAA |
72/370 | 0.0 | 100% | intergenic (–/‑114) | –/unknown | –/Transposase, IS200 family |
| ? | 6 | = 31282 | 0 (0.000) | intergenic (+44/–) | unknown/– | SSU ribosomal protein S17p (S11e)/– | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
ATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/272‑28‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAACGAAAGATTT < 6/31282‑31035 |||||||||||||||||||||||||||||| ATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTT > 1:426893/1‑249 CTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGC < 1:820108/251‑1 ACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTA > 1:253824/1‑251 ACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTA > 1:882921/1‑251 ACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTA > 1:826463/1‑251 ACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTA > 1:710088/1‑251 ACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTA > 1:501684/1‑251 TATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGAC < 1:397504/251‑1 AAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTA < 1:771585/251‑1 GTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTA > 1:792200/1‑242 GTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTT < 1:167680/220‑1 TTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGAT < 1:159722/251‑1 TTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCT > 1:681684/1‑215 TTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAccgtacgctatgca < 1:105846/251‑15 TATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATC < 1:458364/251‑1 GGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGT < 1:231479/206‑1 TGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTAT < 1:624551/251‑1 ATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTT > 1:318599/1‑251 GTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTA > 1:894113/1‑250 GTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTA > 1:379062/1‑250 TCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAAT > 1:321730/1‑214 CATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCT < 1:652798/251‑1 TTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGC < 1:446386/183‑1 GATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAAT < 1:574402/224‑1 ATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACAC < 1:210666/251‑1 AATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAG < 1:518275/251‑1 TCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGT > 1:524594/1‑247 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TTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACTACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACT < 1:157612/251‑1 CATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTG > 1:662965/1‑250 CATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGT < 1:147955/231‑1 CATATGCATAGCGTACGGTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTA > 1:262573/1‑182 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GTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAG < 1:329308/241‑1 GTTTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTT < 1:245954/65‑1 TTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAA > 1:402815/1‑250 TTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTAC < 1:740236/161‑1 TTTATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTAC < 1:248576/161‑1 ATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTT > 1:189341/1‑251 ATTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAG < 1:440812/236‑1 TAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTTTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACT > 1:91453/1‑154 TAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTT > 1:858970/1‑251 TAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCT < 1:375881/245‑1 TAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTT > 1:864571/1‑239 TAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCG < 1:867476/144‑1 GCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCA > 1:400169/1‑251 GCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCA > 1:372670/1‑251 TAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAAT < 1:459603/251‑1 GACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGT < 1:39472/198‑1 ACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAG > 1:198585/1‑250 ACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGAT < 1:596277/108‑1 TTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAA < 1:847553/250‑1 GTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAA > 1:9667/1‑251 GTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAA > 1:529875/1‑251 GTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAA > 1:106849/1‑251 AAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAACGAAAGATTT > 1:430804/1‑251 |||||||||||||||||||||||||||||| ATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/272‑28‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTTGCGTTCAATAGCAACAACGAAAGATTT < 6/31282‑31035 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |