| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1633644 | 80 (0.980) | 27 (0.290) +GTGTCC |
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| ? | 2 | 102 = | 0 (0.000) | intergenic (‑20/+52) | unknown/unknown | hypothetical protein/Excinuclease ABC subunit A | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GTTCCGGGATTTCAATCGCTTTCTTTTTCATCTTTGGCTTCACTATTTTAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTAGCCAATAAATGACGAGCGAATGGGAGATTTTATGAAGTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGGTAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCAAAAAATCCGGTAAAATTTGCATAATTTAAGGACATTAAAATGAAAAAAATAGCATTAGCTCTAGGATTAACCTTTCTAAGCATTCTCCGTTACCGTGCAAAAAGATGGCGAATTAATTTTGAACGGGAACGAAATTAGCTATAAAAGCTGGCAATCGCCTGATCTGACAGGAAAAGTCCGAGTGATCCAACATTTAGCCAGCAGAAGTAG > 1/1633394‑1633891 | gTTCCGGGATTTCAATCGCTTTCTTTTTCATCTTTGGCTTCACTATTTTAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAATGCTTTTAGCCAATAAATGACGAGCGAATGGGAGTTTTTATGAAGTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGGTAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAg > 1:594780/1‑251 (MQ=18) 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atataAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAATGCTTTTAGCCAATAAATGACGAGCGAATGGGAGATTTTATGAAGTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGGTAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCAAAAAATCCGGTAAAATTTGCATAATTTa > 1:110887/1‑251 (MQ=255) aaGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAATGCTTTTAGCCAATAAATGACGAGCGAATGGGAGATTTTATGAAGTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGGTAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCAAAAAATCCGGTAAAATTTGCATAATTTAAGGa < 1:155840/251‑1 (MQ=255) aaGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAATGCTTTTAGCCAATAAATGACGAGCGAATGGGAGATTTTATGAAGTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGGTAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCAAAAAATCCGGTAAAATTTGCATAATTTAAGGa < 1:853646/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |