| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1299093 = | NA (NA) | 19 (0.270) +GCCTGATAGGGAGCCCTGATGTGAGAGCATCGGGGC |
7/358 | 5.2 | 57.3% | intergenic (‑177/+395) | unknown/unknown | tRNA‑Asp‑GTC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 1657605 | 17 (0.200) | intergenic (‑147/+94) | unknown/unknown | Transposase, IS200 family/CTP synthase (EC 6.3.4.2) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAA > 1/1298864‑1299327 | ccGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTcaca < 1:250296/251‑1 (MQ=255) aCCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATgggg < 1:381111/251‑1 (MQ=255) aCCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATgggg < 1:312311/251‑1 (MQ=255) gcaggTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCacac < 1:174381/246‑1 (MQ=255) gcaggTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTAc < 1:863417/249‑1 (MQ=255) caggTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCa < 1:625970/250‑1 (MQ=255) cAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGc > 1:754039/1‑250 (MQ=255) cTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATgg < 1:747691/205‑1 (MQ=255) gAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACtctc > 1:821026/1‑194 (MQ=255) gaATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGAt > 1:406522/1‑198 (MQ=255) gaATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGt > 1:893938/1‑250 (MQ=255) aaTTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGttt > 1:115570/1‑251 (MQ=255) aaTTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGttt < 1:21845/251‑1 (MQ=255) aaTTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGttt < 1:84400/251‑1 (MQ=255) aTTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTc < 1:260900/251‑1 (MQ=255) aGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg > 1:175392/1‑251 (MQ=255) gTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCgg < 1:468053/167‑1 (MQ=255) gACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGc < 1:682070/214‑1 (MQ=255) gACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCACTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGttt > 1:594167/1‑241 (MQ=255) cTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTaccac < 1:645943/251‑1 (MQ=255) aCTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCg > 1:676087/1‑251 (MQ=255) ctcACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGAt > 1:482805/1‑179 (MQ=255) ctcACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCAc > 1:673063/1‑213 (MQ=255) cacaTAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTAc < 1:21967/189‑1 (MQ=255) cacaTAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACgg < 1:757444/203‑1 (MQ=255) cacaTAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGc > 1:570757/1‑247 (MQ=255) cacaTAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTa > 1:490783/1‑251 (MQ=255) gggATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTActc > 1:791366/1‑159 (MQ=255) ccccACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGt > 1:706150/1‑207 (MQ=255) ccccACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAata > 1:817738/1‑251 (MQ=255) ccACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGc > 1:296385/1‑182 (MQ=255) acacTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTacc < 1:29568/226‑1 (MQ=255) acacTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCCATAtt > 1:399556/1‑249 (MQ=255) acacTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATAtt > 1:383846/1‑249 (MQ=255) aCCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTtgat > 1:212251/1‑251 (MQ=255) aCCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTtgat > 1:82608/1‑251 (MQ=255) ccATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTtgatg < 1:598591/251‑1 (MQ=255) ggCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTAt > 1:858867/1‑251 (MQ=255) gCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTActct > 1:706023/1‑138 (MQ=255) cTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCcgcg > 1:695489/1‑251 (MQ=255) tCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTc < 1:178418/175‑1 (MQ=255) gAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGcgcttt > 1:203083/1‑250 (MQ=255) gTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTAc < 1:54941/150‑1 (MQ=255) ggATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTAtt > 1:700309/1‑251 (MQ=255) aTTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc < 1:746938/250‑1 (MQ=255) ggCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCAc < 1:561820/141‑1 (MQ=255) ctctACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGt > 1:642902/1‑147 (MQ=255) ctACTGCCCTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc > 1:59431/1‑238 (MQ=255) ctACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCtt > 1:59384/1‑250 (MQ=255) ctACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTtc < 1:575710/251‑1 (MQ=255) gCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCg > 1:466032/1‑251 (MQ=255) cACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTActc > 1:527655/1‑85 (MQ=255) cACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc < 1:175420/232‑1 (MQ=255) cTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATcc > 1:198379/1‑192 (MQ=255) aCTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAggt < 1:405423/131‑1 (MQ=255) aCTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTc < 1:185797/161‑1 (MQ=255) aCTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACttcctttc > 1:634402/1‑249 (MQ=255) aCTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACttcctttc > 1:770200/1‑249 (MQ=255) aCTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGt < 1:505694/104‑1 (MQ=255) cTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCtata > 1:869331/1‑250 (MQ=255) tAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGttt > 1:728171/1‑114 (MQ=255) tAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACttcctttcc < 1:324120/238‑1 (MQ=255) aCAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg < 1:266859/251‑1 (MQ=255) aCAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg < 1:691529/251‑1 (MQ=255) aCAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg < 1:261772/251‑1 (MQ=255) aCTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCTGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTcc < 1:232126/249‑1 (MQ=255) gAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAatat > 1:637993/1‑137 (MQ=255) gAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg < 1:836085/243‑1 (MQ=39) gAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg > 1:610039/1‑243 (MQ=39) gAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg > 1:9321/1‑243 (MQ=39) gAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCtctc > 1:333476/1‑250 (MQ=39) tAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCaaa < 1:46900/251‑1 (MQ=38) aaCTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCaaaaa < 1:104713/251‑1 (MQ=37) gTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTccc > 1:520378/1‑200 (MQ=34) aaaTTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc < 1:220759/168‑1 (MQ=32) aTTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATAcgcg > 1:640673/1‑224 (MQ=11) | CCGCGACCCCCTGCGTGACAGGCAGGTATTCTAACCAGCTGAACTACCACTCCAGAATGAGAATTAGCAGTGACCTACTCTCACATAGGGATGCCCCACACTACCATTGGCGTAACAGCATTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGATTCAGGTGGCTCTACTGCACTATAACTGCTAAAATTTTTATTACTTTAGCTTACTAACAAGACTGAATAAACTAAAGTAATAAATTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTTCTTACTTCCTTTCCTGCACGCTATACGCGTCCTCTCCAAAAA > 1/1298864‑1299327 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |