| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1207763 | NA (NA) | 33 (0.400) +TATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTT |
28/372 | 1.4 | 100% | intergenic (‑213/+70) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/Glutamate racemase (EC 5.1.1.3) |
| ? | 2 | = 176511 | 0 (0.000) | intergenic (‑277/–) | unknown/– | Transaldolase (EC 2.2.1.2)/– | |||||
TTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCATTTTTGTGCAAAACACTTGATTATTTGTTTGATTTTTTGACCGCACTTTTACGTCACTAAGCAAGGATTCCACCCGTTT > 1/1207515‑1208012 | ttCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATCATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCt < 1:774938/251‑1 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1:899665/1‑246 (MQ=21) aTCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACtaaaaatttaaaaatattttcaactggttattttttagatcttttgtgcagaaattagcctgggcagatccgcgatagaatccagcacataatcggcttccttttctcc > 1:350022‑M1/1‑140 (MQ=255) aTCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACtaaaaatttaaaaatattttcaactggttattttttagatcttttgtgcagaaattagcc < 1:715299‑M1/200‑61 (MQ=255) tCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACtaaaaatttaaaaatattttcaactggttattttttagatcttttgtgcagaaattagcctgggcagatccgcgatagaatccagcacataatc > 1:648550‑M1/1‑139 (MQ=255) 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1:409900/1‑251 (MQ=255) cTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACtaaaaatttaaaaatattttcaactggttattttttagatcttttgtgcagaaattagcctgggcagatccgcgatagaatccagcacataatcggcttccttttctccctccgacgtgacctctttacccgtacgtactaagatagtcgtacctattttcgcccctttccccgccaaaagat > 1:420519‑M1/1‑68 (MQ=255) cTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACtaaaaatttaaaaatattttcaactggttattttttagatcttttgtgcagaaattagcctgggc > 1:645446‑M1/1‑68 (MQ=255) cTACAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCaa > 1:97732/1‑158 (MQ=255) aCAACGGCGCGCCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGCTTTTATCCTTACCTTGCAAGTACTTTTTTACAAAAAATTTAAAAATCTTTTTGATTGCTTATTTTTTGTCAAATTTCTCTCAAAACCTCACTATCGACATCTAATAAACGCAGCGTTTCAAATCCTAAAGACTGAATTAAATTTGGTAAACCGTCTTCCGGTGAGATCATTTTTGTGc > 1:728484/1‑213 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |