| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1207763 | NA (NA) | 33 (0.400) +TATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTT |
28/372 | 1.4 | 100% | intergenic (‑213/+70) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/Glutamate racemase (EC 5.1.1.3) |
| ? | 2 | = 176511 | 0 (0.000) | intergenic (‑277/–) | unknown/– | Transaldolase (EC 2.2.1.2)/– | |||||
ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1207656‑1207763‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTTCCGGTAGTTTTTTGCCACGGATATGAT < 2/176511‑176301 ||||||||||||||||||||||||||||| ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACA > 1:602818/1‑234ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATAT < 1:244724/217‑1ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATA < 1:34798/216‑1ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAAT > 1:222207/1‑190ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACT < 1:791010/116‑1 CTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTT > 1:361826/1‑251 TAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACT > 1:328517/1‑111 GTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAAC < 1:557736/214‑1 CCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTC > 1:676167/1‑110 CCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATT < 1:727560/101‑1 CAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATAC > 1:81585/1‑194 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACC < 1:278983/225‑1 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGC < 1:633210/177‑1 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATT > 1:329290/1‑156 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAA > 1:826667/1‑154 TTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAAC > 1:595851/1‑201 GTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTA < 1:889687/94‑1 ATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACC > 1:75158/1‑212 TTGTTAAAGAACAACAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGACCTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATCAAACCTATTAATT > 1:57262/1‑219 AACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGT < 1:326144/250‑1 CTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTC < 1:217373/63‑1 GTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATA > 1:18179/1‑250 GTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACAT > 1:745684/1‑164 GTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTA > 1:501908/1‑50 GTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGT > 1:769798/1‑49 CTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGG > 1:343709/1‑251 CTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACA > 1:205179/1‑161 CTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCAT < 1:362490/118‑1 TAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTA < 1:554320/251‑1 CCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTT < 1:506372/251‑1 CCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTT < 1:165761/251‑1 CCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAAT < 1:439496/120‑1 TCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTTCCGGTAGTTTTTTG > 1:738718/1‑250 TCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAA < 1:392301/193‑1 GCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATAT > 1:121335/1‑223 CGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAG > 1:20355/1‑183 GTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAA > 1:441756/1‑180 TATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTTCCGGTAGTTTTTTGCCACGGATATGAT < 1:267703/249‑1 TTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTAT > 1:16149/1‑175 GGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAG < 1:182063/185‑1 GTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCAT > 1:321767/1‑78 TTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAG < 1:334633/180‑1 TACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATAC < 1:697974/199‑1 TACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCAT < 1:222388/68‑1 ||||||||||||||||||||||||||||| ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1207656‑1207763‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACATTAATTTAACAAGATAAAACCTATTAATTTCATTATGTGAAACGCGCTTTTATAAAGGTATTTTAAAGTTGCTTTCTGTATCAAATACGGTTATATTTCCGGTAGTTTTTTGCCACGGATATGAT < 2/176511‑176301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |