| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | = 1202126 | 11 (0.130) | 59 (1.290) +CAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCT |
42/234 | 0.0 | 90.8% | intergenic (+117/+478) | unknown/unknown | Na+/H+ antiporter/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1657336 = | NA (NA) | coding (123/369 nt) | unknown | Transposase, IS200 family | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTATGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGGGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAATAGCGTACGGTTTTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTC > 1/1201877‑1202372 | ttATGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAAc < 1:873799‑M1/251‑2 (MQ=255) 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TTATGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGGGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAATAGCGTACGGTTTTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTC > 1/1201877‑1202372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |